❄ زمســـتان در راه اسـت... اما این همه ماجرا نیــست! 

🍉 به مناسبت شــب یلــدا و آغــاز زمســتان، آماده یک خبر هیجان‌انگیز باشید. خبری که احتمالاً مـدت‌ها منتــظـرش بودید! 

📢 ما برای اعلام این موضوع بسـیار هیجان‌زده‌ایم و بـی‌صبـرانه منتــظر استـقـبـال شما دانـشـجـویـان و پـژوهشـگـران عـزیـز هســتـیم. 
❄ زمـسـتان امسال، پر از ماجراهای علمی برای دوست‍ــداران حـوزه زیسـت‌شنـاسی محاسـباتی خواهـد بود! 

📝 از همین حالا رزومه‌های خود را آماده کنید تا از این اتفاق بزرگ جا نمانید. 🚀 
منتظر باشید...

🚀 Rayazi Group
🚀 Bioinformatic Research Group

🎉 یلدای علم و نوآوری در زیست‌شناسی محاسباتی! 🍬

بلندترین شب سال فرصتی ویژه برای دانشجویان و پژوهشگران ایرانی حوزه‌ی زیست‌شناسی محاسباتی به همراه دارد!

💡 گروه تحقیقاتی رایازی، با همکاری انجمن RSG Iran و با هدف ارتقای توان علمی دانشجویان و تسهیل ارتباط تیم‌های پژوهشی، بستری فراهم کرده تا شما بتوانید با اساتید برجسته ایرانی در حوزه‌‌ی زیست شناسی محاسباتی، از دانشگاه‌های معتبر جهان در پروژه‌های تحقیقاتی همکاری کنید.

📜 در مرحله اول، پروپوزال‌های پژوهشی منتخب از طریق سایت رایازی در اختیار شما علاقه‌مندان قرار خواهد گرفت.

📚 با مطالعه این پروپوزال‌ها، می‌توانید تمایل خود را برای مشارکت در پروژه‌های مرتبط اعلام کنید.

✅ انتخاب افراد براساس توانایی پاسخگویی به پرسشنامه اختصاصی هر پروژه و بررسی رزومه شما توسط اساتید انجام خواهد شد.

💬 رایازی تنها به‌عنوان پلی ارتباطی عمل می‌کند و انتخاب تیم‌ها و پیشبرد پروژه‌ها بر عهده اساتید است.

⭐️ اگر به دنبال توسعه دانش و مهارت‌های خود در این حوزه هستید، این فرصت را از دست ندهید!

✨ یلدایتان پر از دانش، نوآوری و موفقیت! ✨

🚀 Rayazi Group
🚀 Bioinformatic Research Group

🚀 رایازی پلی برای ارتباط دانشجویان و اساتید برای یک هدف مشترک است؛ که آن هدف، آغاز پژوهش است!

🎯در راستای این هدف، رایازی با اساتید و پژوهشگرانی از اقصی نقاط دنیا ارتباط گرفته و آن‌ها را به همکاری پژوهشی دعوت می‌کند.

📣 اساتید پروژه‌های پژوهشی خود را در وبسایت رایازی ثبت‌ می‌کنند و هر دانشجو می‌تواند بسته به علاقه و مهارت خود برای آن پروژه‌ اپلای کند.

🚀 Rayazi Bioinformatics Research Group

🖥Join us:
www.Rayazi.com

🔗Contact us:
@RayaziAdmin

🔥 رقابت برای پژوهش با پروژه‌های فاز اول رایازی!

🧬 گروه تحقیقاتی رایازی با همکاری انجمن RSG ایران، با افتخار فاز اول پروژه‌های پژوهشی Rayazi Lab را معرفی می‌کند:

فرصتی بی‌نظیر، برای ارتباط دانشجویان و پژوهشگران ایرانی با اساتید برجسته ایرانی از دانشگاه‌های معتبر دنیا و همکاری در پروژه‌های پیشرفته زیست‌شناسی محاسباتی.

💡 در این مرحله، 6 پروژه پژوهشی تحت نظارت مستقیم اساتید مطرح ایرانی، از داخل و خارج کشور، به شرح ذیل در سایت رایازی قرار گرفته است:

✔ دکتر محی‌الدین جعفری(دانشگاه Helsinki)
✔ دکتر بابک خرسند (دانشگاه UCI)
✔ دکتر رضا رسول‌زاده (دانشگاه Fluminense)
✔ دکتر محمدعلی خان میرزایی (مرکز Helmholtz)
✔ آقای مهرداد عامری (دانشگاه علوم پزشکی شیراز)
✔ خانم عطیه احمدی (دانشگاه Waterloo)

📚 وارد سایت رایازی شوید و شرح تمامی پروژه‌ها را در بخش Research سایت رایازی مطالعه کنید و سپس برای پروژه دلخواه خود اپلای کنید!

1️⃣ هر دانشجو تنها می‌تواند برای یک پروژه اپلای کند.

⏳ مهلت اعلام آمادگی: 
بازه‌ی 21 روزه برای ثبت‌نام و ارسال اطلاعات اولیه (رزومه و پاسخ به سوالات/تسک‌های اختصاصی هر پروژه) در نظر گرفته شده است.

✔️این ارزیابی اولیه، فرصتی برای نشان دادن توانایی‌ها و آغاز همکاری در یک پروژه علمی است.

🎯 هدف ما ایجاد پلی برای همکاری دانشجویان داخل ایران با اساتید ایرانی در سراسر دنیا و ارتقای توان علمی پژوهشگران جوان است.

💥 این فرصت بی‌نظیر را از دست ندهید! 
منتظر حضور پرانرژی شما در این رقابت پژوهشی هستیم. 🌟

🚀Rayazi Bioinformatics Research Group

🖥Join us:
www.Rayazi.com

🔗Contact us:
@RayaziAdmin

⁉️ گام به گام اپلای در پروژه‌های پژوهشی رایازی!

برای اینکه در یکی از ۶ پروژه‌ی پژوهشی رایازی اپلای کنید
ابتدا از این صفحه توضیحات پروژه‌ها رو به دقت بخونید و پروژه‌ای که موردعلاقه‌تون هست رو پیدا کنید.

👆سپس روی
apply for this project
کلیک کنید

و در دو مرحله‌ی بعدی
روی open application form
کلیک کنید
و به سوالاتی که در اپلیکیشن فرم ازتون پرسیده میشه پاسخ بدید.

✉️ پاسخ شما به این سوالات معیار سنجش توانایی شماست

🎮 معرفی پروژ‌ه‌های پژوهشی فاز ۱ رایازی

📌موضوع پروژه:
Calculating polygenic risk score for Adni3 patients
🔖زیر نظر: جناب آقای دکتر بابک خرسند

➖در مرحله اولیه این پروژه، از شرکت کنندگان انتظار می‌رود که با استفاده از مجموعه داده‌های ارائه شده، مهارت‌های پژوهشی و درک مفاهیم مورد نیاز برای محاسبه امتیاز خطر چند ژنی برای بیماران ADNI3 را نشان دهند. که از طریق یک گزارش جامع و مفصل که محاسبات و روش‌شناسی آن‌ها مشخص است ارائه دهند.

🔣 متقاضیانی که این محاسبات را با موفقیت انجام دهند، این فرصت را خواهند داشت که در پروژه های تحقیقاتی مشابه، با مجموعه داده‌های جدید در موضوعات مرتبط شرکت کنند.

🖥 برای ارسال درخواست شرکت در پروژه بر روی واژه بیوانفورماتیک کلیک کنید.

🚀Rayazi Bioinformatics Research Group

🌐Join us:
www.Rayazi.com

🔗Contact us:
@RayaziAdmin

🎮 معرفی پروژه‌های پژوهشی فاز ۱ رایازی

📌موضوع:
📎 Phage-derived antibacterials

🔖زیرنظر: محمد علی خان میرزایی

➖ شیوع گسترده باکتری‌های مقاوم به آنتی‌بیوتیک؛ تهدیدی قابل توجه برای سلامت انسان در جهان است. آنتی‌بیوتیک‌های جدید فرآیندی کند و پرهزینه است، بنابراین یک راه حل جایگزین برای آن، کشف فاژهاست که شکارچیان طبیعی باکتری‌ها هستند.

⭐️هدف ما بررسی ژنوم فاژ به‌عنوان منبع مناسب عوامل ضد باکتری جدید است. زمانی که ژن‌ها با ویژگی‌های مورد نظر را شناسایی کردیم، کارآیی آن‌ها را تایید کرده و آن‌ها را به عنوان درمان‌های مستقل تولید می‌کنیم.

➖ این پروژه از دو بخش محاسباتی و تجربی تشکیل شده است. انتظار می‌رود بخش محاسباتی بسته به تخصیص زمان و مهارت‌های مشارکت‌کنندگان، ظرف 6 تا 12 ماه تکمیل شود. بسته به یافته ها، بخش آزمایشی ممکن است تا دو سال طول بکشد.

🖥 برای ارسال درخواست شرکت در پروژه بر روی واژه بیوانفورماتیک کلیک کنید.

🚀Rayazi Bioinformatics Research Group

🌐Join us:
www.Rayazi.com

🔗Contact us:
@RayaziAdmin

🎮 معرفی پروژه‌های پژوهشی فاز ۱ رایازی

📌موضوع:
📎 Integrated Single-cell and Bulk RNA-seq Analysis of the Immune Microenvironment in Gastric Cancer Progression

🔖زیرنظر: مهرداد عامری

❓سوال اصلی پروژه:
🔣 تعاملات مولکولی کلیدی و دینامیک سلولی در ریزمحیط ایمنی که باعث پیشرفت سرطان معده می‌شود، بر اساس یافته داده‌های RNA-seq یکپارچه تک سلولی و حجیم چیست؟


⭐️ هدف این پروژه
بررسی مکانیسم‌های مولکولی ریزمحیط ایمنی در پیشرفت سرطان معده از طریق تجزیه و تحلیل یکپارچه داده‌های توالی‌یابی RNA تک سلولی (scRNA-seq) و توالی RNA حجیم (RNA-seq) است.

🔣 این مطالعه به دنبال کشف تغییرات مهمی است که رشد تومور و فرار سیستم ایمنی را تسهیل می‌کند.

🔣علاوه‌بر این، بیومارکرهای پیش آگهی برای درک بهتر تأثیر آن‌ها بر نتایج بیمار مورد بررسی قرار خواهند گرفت.



🖥 برای ارسال درخواست شرکت در پروژه بر روی واژه بیوانفورماتیک کلیک کنید‌.


🚀Rayazi Bioinformatics Research Group

🌐Join us:
www.Rayazi.com

🔗Contact us:
@RayaziAdmin

🎮 معرفی پروژه‌های پژوهشی فاز ۱ رایازی

📌موضوع:
📎Exploration of the factors contributing to the high fidelity of DNA polymerases in KOD1

🔖زیرنظر: عطیه احمدی

❓ سوال اصلی پروژه:

🔣 هدف این پروژه بررسی عواملی است که به پایداری بالای DNA پلیمرازها در KOd1، یک آرکئون هایپرترموفیل که به دلیل مکانیسم‌های قوی همانندسازی DNA معروف است، کمک می‌کند.

➖با مشخص کردن خواص و برهمکنش‌های خاص این پلیمرازها، ما به دنبال درک مبنای مولکولی برای دقت قابل توجه آنها هستیم.


🔣 هدف این پروژه بررسی عواملی است که به پایداری بالای DNA پلیمرازها در KOd1، آرکئون هایپرترموفیل که به دلیل مکانیسم‌های قوی همانندسازی DNA معروف است، کمک می‌کند.

➖ با مشخص کردن خواص و برهمکنش‌های خاص این پلیمرازها، ما به دنبال درک مبنای مولکولی برای دقت قابل توجه آن‌ها هستیم.

🔣 این تحقیق پیامدهایی برای کاربردهای بیوتکنولوژی دارد، جایی که همانندسازی DNA با پایداری بالا بسیار مهم است و می‌تواند یافته‌هایی را در مورد تکامل ماشین‌های تکثیر DNA در محیط‌های شدید ارائه دهد.

➖ این پروژه ترکیبی از سنجش‌های بیوشیمیایی، آنالیز ساختاری و ژنومیک مقایسه‌ای برای کشف مکانیسم‌های اساسی پایداری پلیمراز است.

🖥 برای ارسال درخواست شرکت در پروژه بر روی واژه بیوانفورماتیک کلیک کنید.

🚀Rayazi Bioinformatics Research Group

🌐Join us:
www.Rayazi.com

🔗Contact us:
@RayaziAdmin

🎮 معرفی پروژه‌های پژوهشی فاز ۱ رایازی

📌موضوع:
📎 Investigating the Dynamic Behavior of Biological Network Motifs

🔖زیر نظر: محی الدین جعفری

➖در علم شبکه، یک موتیف نشان دهنده یک الگوی زیرگراف تکرار شونده و معنی‌دار در یک شبکه بزرگ‌تر است. این قسمت‌ها اغلب ویژگی‌های ساختاری یا عملکردی مشترکی را نشان می‌دهند که اغلب در شبکه‌های بیولوژیکی مشاهده می‌شوند، مانند:
🔣 حلقه‌های پیش‌خور
🔣حلقه‌های بازخورد
🔣مسیرهای سیگنالینگ.

➖ مدل‌سازی پویا موتیف‌های شبکه شامل: بررسی چگونگی تکامل و تعامل این موتیف‌ها در طول زمان، با در نظر گرفتن عواملی مانند:
🔣تغییرات در حالت‌های گره
🔣 تعاملات بین گره‌ها و تأثیرات خارجی بر روی شبکه است.

➖ این رویکرد محققان را قادر می‌سازد تا یافته‌های جدیدی را در مورد رفتار دینامیکی سیستم‌های بیولوژیکی در سطح موتیف‌های شبکه کشف کنند و اطلاعات ارزشمندی را در مورد پایداری، استحکام و پاسخ به محرک‌ها یا آشفتگی‌ها ارائه دهند.


⭐️در این پروژه، هدف اصلی ما این است که
به طبقه‌بندی رفتار دینامیکی نشان‌داده‌شده توسط موتیف‌های شبکه بیولوژیکی بپردازیم.

✔️ برای رسیدن به این هدف، ما از مدل‌سازی شبکه بولی به عنوان چارچوب اساسی خود استفاده می‌کنیم و از ظرفیت آن برای شبیه‌سازی پویایی پیچیده ذاتی در شبکه‌های بیولوژیکی استفاده می‌کنیم.

➕علاوه بر این، ما روش‌های یادگیری ماشینی پیچیده را در رویکرد خود اضافه می‌کنیم و از آن‌ها به‌عنوان طبقه‌بندی‌کننده‌های قدرتمند برای تشخیص و دسته‌بندی الگوهای دینامیکی مختلف مشاهده شده در این نقش‌ها استفاده می‌کنیم.

✔️ هدف ما ارائه یک درک جامع از رفتار پویا موتیف‌های شبکه بیولوژیکی است که از این طریق به پیشرفت علم شبکه و زیست‌شناسی سیستم‌ها کمک کند.

🖥 برای ارسال درخواست شرکت در پروژه بر روی واژه بیوانفورماتیک کلیک کنید.

🚀Rayazi Bioinformatics Research Group

🌐Join us:
www.Rayazi.com

🔗Contact us:
@RayaziAdmin

🎮 معرفی پروژه‌های پژوهشی فاز ۱ رایازی

📌موضوع:
📎Effects of carbon nanotubes & pollutants on the conformation of HEP, TSHR, BRCA and HSP proteins: Molecular Dynamics Simulation

🔖زیر نظر: رضا رسول‌زاده


بررسی آلاینده‌های زیست‌محیطی و نانولوله‌های کربنی بر روی پروتئین‌ها

🔤 با توجه به پتانسیل گسترده نانوذرات مانند: نانوساختارهای کربنی و کاربردهای بیولوژیکی و پزشکی آن‌ها، بحث در مورد نانو سمیت آن‌ها در برهمکنش با پروتئین‌ها و تأثیر منفی آلاینده‌های محیطی بر بیوماکرومولکول‌ها که منجر به تغییرات ساختاری و عملکردی می‌شود ضروری است.

🔤 مطالعات اخیر نشان داده است که نانولوله‌های کربنی و گرافن به دلیل اندازه کوچک، چگالی کم، سختی بالا، استحکام بالا و خواص الکتریکی عالی می‌توانند برای اهداف بیولوژیکی مانند شناسایی و تخریب سلول‌های سرطانی، مهندسی بافت، تبلور پروتئین، ساخت بیوراکتورها و حسگرهای زیستی و جاذب آلاینده‌ها. با توجه به نگرانی‌های ایمنی زیستی، مطالعه برهم‌کنش نانولوله‌های کربنی با پروتئین‌ها می‌تواند کلیدی برای یافتن اطلاعات بیشتر در زمینه نانوسم‌شناسی و طراحی حسگرهای زیستی مورد استفاده در صنایع مختلف مانند داروسازی، خودروسازی و کشاورزی باشد.

🔤 از جمله پروتئین ‌های قابل استفاده برای این تحقیق می‌توان به پروتئین‌های خون، پروتئین‌های سرطانی، گیرنده‌های تیروئید و HSP اشاره کرد.

بنابراین مطالعه مجموعه نانوساختارهای کربنی و آلاینده‌های محیطی با پروتئین‌ها، احتمال سمیت پروتئین‌ها توسط این کمپلکس‌ها را روشن می‌کند. بنابراین، هدف ما بررسی اتصال این پروتئین‌ها به مجموعه نانولوله‌های کربنی و آلاینده‌های مختلف محیطی است تا کمترین تغییرات ساختاری و عملکردی در بیوماکرومولکول‌ها به‌ویژه این پروتئین‌ها را محقق کنیم.


🖥 برای ارسال درخواست شرکت در پروژه بر روی واژه بیوانفورماتیک کلیک کنید.

🚀Rayazi Bioinformatics Research Group

🌐Join us:
www.Rayazi.com

🔗Contact us:
@RayaziAdmin