Forwarded from Lobastov’s Scientific Library
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
🎥Формы научных публикаций🎥
Пока мы ждём запись остальных докладов (с которыми я категорически рекомендую ознакомиться всем интересующимся клиническими исследованиями) с недавно прошедшей в КГМУ конференции молодых учёныхи инноваторов , я поделюсь с вами своей короткой (12 минут) презентацией на тему "Публикация результатов клинического исследования: взгляд автора научной статьи".
Надеюсь, что она хоть кому-то послужит стимулом что-то написать и опубликовать👨💻
#видеолекция
Пока мы ждём запись остальных докладов (с которыми я категорически рекомендую ознакомиться всем интересующимся клиническими исследованиями) с недавно прошедшей в КГМУ конференции молодых учёных
Надеюсь, что она хоть кому-то послужит стимулом что-то написать и опубликовать
#видеолекция
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Бурлов.pdf
1.8 MB
Уважаемые коллеги, добрый день!
Продолжаем знакомить Вас с лекциями, которые наши спикеры представили в рамках "Школы молодых ученых и инноваторов"
Делимся презентацией и записью (ЮТУБ и ВК) выступления на тему: "Давай померимся» или что такое индекс Хирша?"
Лекцию читает: Бурлов Никита Николаевич, врач-хирург, автор канала Ebm_base (https://www.group-telegram.com/ebm_base.com), Нижний Тагил
В лекции Никита Николаевич Бурлов расскажет об индексе Хирша и попробует ответить на следующие вопросы:
➣Каковы его особенности и интерпретация?
➣Сколько ему (индексу) лет?
➣Что преследовал Хирш, создавая свой индекс?
➣Где можно найти индекс Хирша авторов?
➣Какие есть преимущества и ограничения?
➣Индексация журналов и индекс Хирша.
➣Какие есть альтернативы индексу Хирша?
➣В лекции вы узнаете как «отрастить» себе Хирша. А нужно ли и для чего - на эти вопросы ответить должны Вы.
P.S. Академия будет рада если Никита Николаевич дополнительно раскроет тему альтернативных индексов.
Продолжаем знакомить Вас с лекциями, которые наши спикеры представили в рамках "Школы молодых ученых и инноваторов"
Делимся презентацией и записью (ЮТУБ и ВК) выступления на тему: "Давай померимся» или что такое индекс Хирша?"
Лекцию читает: Бурлов Никита Николаевич, врач-хирург, автор канала Ebm_base (https://www.group-telegram.com/ebm_base.com), Нижний Тагил
В лекции Никита Николаевич Бурлов расскажет об индексе Хирша и попробует ответить на следующие вопросы:
➣Каковы его особенности и интерпретация?
➣Сколько ему (индексу) лет?
➣Что преследовал Хирш, создавая свой индекс?
➣Где можно найти индекс Хирша авторов?
➣Какие есть преимущества и ограничения?
➣Индексация журналов и индекс Хирша.
➣Какие есть альтернативы индексу Хирша?
➣В лекции вы узнаете как «отрастить» себе Хирша. А нужно ли и для чего - на эти вопросы ответить должны Вы.
P.S. Академия будет рада если Никита Николаевич дополнительно раскроет тему альтернативных индексов.
Forwarded from душно про дату
Про оформление отчетов
Меня тут студенты спрашивали про то, до какого знака округлять и как оформлять таблички и чиселка в тексте. Собрал сколько-то источников с пояснениями, выложу и сюда тоже(да, я помню, что обещал про проверки на нормальность, к середине января распинаю проекты, закончится семестр и сяду писать текст =) .
Вообще, это не то чтобы какие-то устоявшиеся правила, это скорее вопрос дизайна, верстки, типографики и стандартов принятых в журнале. У физиков есть какие-то там свои конвенции, но попытка их применить в биомедицинском журнале достаточно часто вызывает непонимание рецензентов (например, у физиков принято среднее и sd округлять до разного количества знаков; биомедикам такое не заходит). Поэтому вместо жестких рекомендаций посоветую штуки, которые можно почитать, чтобы понять, чем руководствоваться при принятии решений (то есть, как можно уточнить правило "верстайте хорошо, а плохо не верстайте"). Начнем с двух статей; в обоих случаях советую почитать также статьи из библиографии, которые они упоминают.
1. Rudiments of Numeracy, Ehrenberg, 1977 — задает самую базовую рамку для верстки таблиц. Очень советую всем, хорошо написано, вынес оттуда много важного, а еще там очень красиво и минималистично. Рекомендасьон.
2. A Case for Simple Tables, Martin Koschat, 2005 — похожий текст, но поновее. На мой вкус, труба пониже, дым пожиже.
Из более объемных текстов можно посмотреть в сторону книжек Tufte; начните с The visual display of quantitative information, 2nd ed., 2007. Там про графики и иллюстрации вообще, но есть и про таблички. Автора люто-бешено котируют ребята из Бюро Горбунова и дизайнеры вообще.
Из более фастфудного: можно погулять по каналу и блогу Ильи Бирмана, он часто пишет про представление информации и таблички. В качестве стартовой точки можете взять вот этот список коротких видосиков с его курса про интерфейс и представление информации, минимум треть из них релевантна и для нас, пишущих и верстающих отчетики.
Есть специальный канал табличный дизайн, там прицельно про это пишут. У них же есть табличный курс, я фоново имею в плане на него сходить, когда будет время и настроение. Я про них писал в первом посте на канале.
Ну и можете погуглить всякие стайлгайды, госты и руководства для инженеров, физиков и верстальщиков, там наверняка этот вопрос будет освещен и нормирован.
А еще 31.12 активной жизни канала исполнился год. Ура и вау, то ли еще будет!🙏
#dataviz #tables
Меня тут студенты спрашивали про то, до какого знака округлять и как оформлять таблички и чиселка в тексте. Собрал сколько-то источников с пояснениями, выложу и сюда тоже
Вообще, это не то чтобы какие-то устоявшиеся правила, это скорее вопрос дизайна, верстки, типографики и стандартов принятых в журнале. У физиков есть какие-то там свои конвенции, но попытка их применить в биомедицинском журнале достаточно часто вызывает непонимание рецензентов (например, у физиков принято среднее и sd округлять до разного количества знаков; биомедикам такое не заходит). Поэтому вместо жестких рекомендаций посоветую штуки, которые можно почитать, чтобы понять, чем руководствоваться при принятии решений (то есть, как можно уточнить правило "верстайте хорошо, а плохо не верстайте"). Начнем с двух статей; в обоих случаях советую почитать также статьи из библиографии, которые они упоминают.
1. Rudiments of Numeracy, Ehrenberg, 1977 — задает самую базовую рамку для верстки таблиц. Очень советую всем, хорошо написано, вынес оттуда много важного, а еще там очень красиво и минималистично. Рекомендасьон.
2. A Case for Simple Tables, Martin Koschat, 2005 — похожий текст, но поновее. На мой вкус, труба пониже, дым пожиже.
Из более объемных текстов можно посмотреть в сторону книжек Tufte; начните с The visual display of quantitative information, 2nd ed., 2007. Там про графики и иллюстрации вообще, но есть и про таблички. Автора люто-бешено котируют ребята из Бюро Горбунова и дизайнеры вообще.
Из более фастфудного: можно погулять по каналу и блогу Ильи Бирмана, он часто пишет про представление информации и таблички. В качестве стартовой точки можете взять вот этот список коротких видосиков с его курса про интерфейс и представление информации, минимум треть из них релевантна и для нас, пишущих и верстающих отчетики.
Есть специальный канал табличный дизайн, там прицельно про это пишут. У них же есть табличный курс, я фоново имею в плане на него сходить, когда будет время и настроение. Я про них писал в первом посте на канале.
Ну и можете погуглить всякие стайлгайды, госты и руководства для инженеров, физиков и верстальщиков, там наверняка этот вопрос будет освещен и нормирован.
А еще 31.12 активной жизни канала исполнился год. Ура и вау, то ли еще будет!
#dataviz #tables
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Telegram
Канал Ильи Бирмана
Заметки, советы, находки
Чат для обсуждения тем из канала (офтоп нельзя):
https://www.group-telegram.com/ilyabirman_chat_2
Классический заблокированный чат канала (там творится дичь):
https://www.group-telegram.com/ilyabirman_chat
Реклама, нюдсы и другие темы:
@ilyabirman
Чат для обсуждения тем из канала (офтоп нельзя):
https://www.group-telegram.com/ilyabirman_chat_2
Классический заблокированный чат канала (там творится дичь):
https://www.group-telegram.com/ilyabirman_chat
Реклама, нюдсы и другие темы:
@ilyabirman
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Иногда такое чувство, что живёшь в среде гениев-писателей. Нафига большинство вокруг пишут книги? Новая мода вместо курса книга?
Forwarded from Lobastov’s Scientific Library (LSL)
📐Байесовская теорема📐
...здорового человека.
О пресвитерианскиом священнике Томасе Байесе я узнал преимущественно во время пандемии ковида. На самом деле, мне и раньше попадались сетевые метаанализы по байесовской методологии, где было указано не просто наличие достоверных различий между группами, но степень веры в то, что один из методов является самым лучшим (этот подход считается более понятным и наглядным по сравнению с вероятностью отвергнуть нулевую гипотезу у фреквенистов). Но уж в ковид-то после появления первых результатов адаптивного, мультиплатформенного, прагматического, объединённого (мы раньше и слов-то таких не знали) исследования ATTAC, ACTIV-4a и REMAP-CAP с байесовской методологией оценки пришлось вникать, как хотя бы интерпретировать полученные результаты.
С тех пор я для себя вынес (исключительно субъективное мнение без претензий на биостатистическую верность изложения ), что байесовский подход:
📊оперирует не самими частотами с их воспроизводимостью и достоверностью, а степенью доверия к полученным результатам на основании глобального моделирования;
📊использует не только апостериорные (т.е. уже известные и полученные в результатах данного наблюдения), но и априорные (полученные в других исследованиях или предположительные) данные, что позволяет моделировать различные ситуации.
Классическим примером использования байесовской статистики является расчёт положительной и отрицательной предсказательной способности диагностического теста (тот же ПЦР при ковиде) на основании априорной распространённости заболевания в популяции.
Как это работает с математической точки зрения, я не разбирался (честно говоря, я вообще не имею большого желания глубоко вникать в то, как ездит автомобиль, летает самолёт и считается статистика, но мне нравится всем эти пользоваться ), но уяснил точку приложения.
И вот, когда мы с Ильёй Вениаминовичем обсуждали, как пристроить шкалу Wells в его диссертацию (в очередной раз доказывать её отрицательную прогностическую ценность совсем не хотелось), я вспомнил про Байеса и про возможность моделирования положительной прогностической ценности на основании априорных величин распространённости ТГВ.
В тот момент я уже был подписан на канал Никиты Бурлова, который, как раз, постил по поводу байесовской статистики, что и подтолкнуло нас к обращению за помощью именно к нему.
В итоге у нас получилась прекрасная совместная статья, доказывающая, что положительная предсказательная способность шкалы Wells зависит от распространённости ТГВ среди обращающихся пациентов, поэтому при её значении >30% вероятность подтвердить ТГВ при наличии высокой клинической вероятности (2 и более балла Wells) становится >80%, что оправдывается начало антикоагулянтной терапии до ультразвуковой верификации тромбоза.
А это, между прочим, является уникальной научной новизной диссертации Ильи Вениаминовича, которую отметил даже Andrew Nicolaides на Европейском венозном форуме.
Статья была опубликована в журнале "Флебология" в декабре прошлого года и находится в открытом доступе, поэтому вы можете ею вдохновиться на использование теоремы Байеса.
А Никите огромная благодарность от всего авторского коллектива!
Мы уже начали думать, что ещё можно взять с пресвитерианского священника🤫
...здорового человека.
О пресвитерианскиом священнике Томасе Байесе я узнал преимущественно во время пандемии ковида. На самом деле, мне и раньше попадались сетевые метаанализы по байесовской методологии, где было указано не просто наличие достоверных различий между группами, но степень веры в то, что один из методов является самым лучшим (этот подход считается более понятным и наглядным по сравнению с вероятностью отвергнуть нулевую гипотезу у фреквенистов). Но уж в ковид-то после появления первых результатов адаптивного, мультиплатформенного, прагматического, объединённого (мы раньше и слов-то таких не знали) исследования ATTAC, ACTIV-4a и REMAP-CAP с байесовской методологией оценки пришлось вникать, как хотя бы интерпретировать полученные результаты.
С тех пор я для себя вынес (
📊оперирует не самими частотами с их воспроизводимостью и достоверностью, а степенью доверия к полученным результатам на основании глобального моделирования;
📊использует не только апостериорные (т.е. уже известные и полученные в результатах данного наблюдения), но и априорные (полученные в других исследованиях или предположительные) данные, что позволяет моделировать различные ситуации.
Классическим примером использования байесовской статистики является расчёт положительной и отрицательной предсказательной способности диагностического теста (тот же ПЦР при ковиде) на основании априорной распространённости заболевания в популяции.
Как это работает с математической точки зрения, я не разбирался (
И вот, когда мы с Ильёй Вениаминовичем обсуждали, как пристроить шкалу Wells в его диссертацию (в очередной раз доказывать её отрицательную прогностическую ценность совсем не хотелось), я вспомнил про Байеса и про возможность моделирования положительной прогностической ценности на основании априорных величин распространённости ТГВ.
В тот момент я уже был подписан на канал Никиты Бурлова, который, как раз, постил по поводу байесовской статистики, что и подтолкнуло нас к обращению за помощью именно к нему.
В итоге у нас получилась прекрасная совместная статья, доказывающая, что положительная предсказательная способность шкалы Wells зависит от распространённости ТГВ среди обращающихся пациентов, поэтому при её значении >30% вероятность подтвердить ТГВ при наличии высокой клинической вероятности (2 и более балла Wells) становится >80%, что оправдывается начало антикоагулянтной терапии до ультразвуковой верификации тромбоза.
А это, между прочим, является уникальной научной новизной диссертации Ильи Вениаминовича, которую отметил даже Andrew Nicolaides на Европейском венозном форуме.
Статья была опубликована в журнале "Флебология" в декабре прошлого года и находится в открытом доступе, поэтому вы можете ею вдохновиться на использование теоремы Байеса.
А Никите огромная благодарность от всего авторского коллектива!
Мы уже начали думать, что ещё можно взять с пресвитерианского священника🤫
Встречаются два незнакомца:
- Привет, представляешь меня опять заблокировали
- Привет, а меня впервые, тебя за что? Опять кого-то оскорблял или обесценивал
- Если бы, шутку не поняли. Хотя людям было весело. А тебя?
- Не знаю, я лег спать, а потом проснулся и с утра увидел
- Весело, а ты представляешь, они ещё ссылки на нас с тобой оставили и чекнули по номеру
- Капец... Что же так задело?
- А ещё они сомневаются в существовании понятия DAG
- Подожди, так ты же здесь писал об этом. А с чего началось все?
- С моего вопроса о нерепрезентативности выборки опроса
- Ну теперь мы увидели подтверждение этому
Все персонажи и ситуация выдуманы, любые совпадения случайны. Не обращайте внимание, я после суток(и не только после них) несмешно шучу))
- Привет, представляешь меня опять заблокировали
- Привет, а меня впервые, тебя за что? Опять кого-то оскорблял или обесценивал
- Если бы, шутку не поняли. Хотя людям было весело. А тебя?
- Не знаю, я лег спать, а потом проснулся и с утра увидел
- Весело, а ты представляешь, они ещё ссылки на нас с тобой оставили и чекнули по номеру
- Капец... Что же так задело?
- А ещё они сомневаются в существовании понятия DAG
- Подожди, так ты же здесь писал об этом. А с чего началось все?
- С моего вопроса о нерепрезентативности выборки опроса
- Ну теперь мы увидели подтверждение этому
Все персонажи и ситуация выдуманы, любые совпадения случайны. Не обращайте внимание, я после суток
В чате по статистике рекламят/поддерживают ту, о ком 2 сообщения выше
Кринж крепчает
Кринж крепчает