A Certain Scientific Impostor
Video
Большая делегация была в СБМ на этой неделе на подписании соглашения о сотрудничестве МФТИ и Роспотреба. Дмитрий Ливанов заглянул в том числе в нашу лабораторию, а мы рассказали немного про наши процессы по синтезу олигов и пептидов.
A Certain Scientific Impostor
А, так вот откуда прорыв варпа произошел. Я все гадаю откуда люди новые набегают, а это оказывается мой старый пост про гугл-дорки завирусился.
P.S.: Дисклеймер - я не претендую на экспертность в OSINT, просто химикам и биологам оказалось довольно полезно знать азы при поиске литературы за пейволлом.
Техножрица, виват! Я тоже тебя читаю)
P.S.: Дисклеймер - я не претендую на экспертность в OSINT, просто химикам и биологам оказалось довольно полезно знать азы при поиске литературы за пейволлом.
Техножрица, виват! Я тоже тебя читаю)
Forwarded from Kirill A
Реально это бородатый трюк
Но на всякий, если кто не знаком - поисковой синтаксис
Но на всякий, если кто не знаком - поисковой синтаксис
Смотрю топ прорывов-2024 по версии Science - ба, все те же на манеже!
Ленакапавир снова украл заголовки в связи с триумфальными результатами третьей фазы слепых и рандомизированных клинических испытаний на выборке 5300 человек в качестве препарата доконтактной профилактики - pre-exposure prophylaxis (PrEP).
В группе получавшей две инъекции ленакапавира в год - ноль заражений. Результаты второго испытания опубликованы в октябре и только подтвердили эффективность.
Первый раз мы про эту молекулу услышали в 2020 году, когда Ленакапавир, тогда проходивший под скромным шифром GS-6207, был выбран молекулой года по версии DrugHunter, на тот момент молекула была на 2 стадии клиники. Я сам узнал о нем впервые в хайлайте ресурса Тимура Маджидова - Хемоинформатика и Молекулярное Моделирование (очень жаль кстати, что частота публикаций сократилась).
Чем молекула интересна?
- это молекула - first-in-class ингибитор капсида белка. Препаратов ингибиторов протеин-протеиновых взаимодействий ранее не существовало. Обычные лекарства от ВИЧ - это ингибиторы протеазы или РНК-полимеразы.
- молекула эффективна против устойчивых штаммов вируса. Тем пациентам, которым не помогает уже никакое лекарство, снижает вирусную нагрузку в 88% случаев.
- препарат показывает пикомолярную активность (105 пМ)
- он обладает уникально низким клиренсом, из-за чего задерживается в организме на ПОЛГОДА после разовой дозы! Вы не ослышались - его клиренс 6 месяцев! Надо отметить, что для такой активности рекомендуемая доза достаточно большая - 450мг. Но зато скорость выведения за полгода не может убрать вещество до неактивной концентрации.
Механизм в двух словах: ингибирование правильной работы капсида происходит через активацию образования неправильной пространственной структуры мономеров.
Но в нюансах много интересного. Механизм достаточно долго изучали, и много интересного про устройство самого капсида HIV накопали в процессе. Сначала предполагали, что Ленакапавир не дает слипаться мономерам капсида, затем - что наоборот, стабилизирует капсид так, что он вовремя не распадается и не выпускает генетический материал. На текущий момент выяснено, что мягкий но прочный капсид HIV в цикле размножения вируса должен дотащить содержимое до ядра клетки, и только там он должен высвободить свою РНК. Ленакапавир делает капсид жестким, но при этом хрупким, и капсид разваливается до достижения ядра, а его содержимое переваривается в цитоплазме хоста.
История создания: Пфайзер сначала опубликовал статью, в которой они рассказали про слабо связывающуюся молекулу, да еще и цитотоксичную. Но зато дали рентгеновскую структуру. Дальше ребята из Gilead, на основе ключевого скаффолда придумали новых молекул, проскринили и нашли как активаторы, так и ингибиторы самоорганизации белков капсида. Логику ингибиторов не поняли, они все сильно отличались, но с активаторами работать и делать дизайн было проще и они решили - а почему бы не искать настолько активный активатор, чтоб нормальный капсид образоваться не мог?
В результате, разработанный активатор формирует предпочтительно гексамеры из белков мономеров капсида, при этом образование пентамеров ингибируется. Отдельно гексамеры не могут собраться в нормальный, прочный и мягкий капсид, потому что для правильного обязательно нужны также пентамеры.
В ходе оптимизации попытались снизить выведение. Растворимость Ленакапавира очень низкая, что позволило использовать его как депо-лекформу с частотой в две инъекции в год.
PS: Оригинальная публикация Gilead: тык
Ленакапавир снова украл заголовки в связи с триумфальными результатами третьей фазы слепых и рандомизированных клинических испытаний на выборке 5300 человек в качестве препарата доконтактной профилактики - pre-exposure prophylaxis (PrEP).
В группе получавшей две инъекции ленакапавира в год - ноль заражений. Результаты второго испытания опубликованы в октябре и только подтвердили эффективность.
Первый раз мы про эту молекулу услышали в 2020 году, когда Ленакапавир, тогда проходивший под скромным шифром GS-6207, был выбран молекулой года по версии DrugHunter, на тот момент молекула была на 2 стадии клиники. Я сам узнал о нем впервые в хайлайте ресурса Тимура Маджидова - Хемоинформатика и Молекулярное Моделирование (очень жаль кстати, что частота публикаций сократилась).
Чем молекула интересна?
- это молекула - first-in-class ингибитор капсида белка. Препаратов ингибиторов протеин-протеиновых взаимодействий ранее не существовало. Обычные лекарства от ВИЧ - это ингибиторы протеазы или РНК-полимеразы.
- молекула эффективна против устойчивых штаммов вируса. Тем пациентам, которым не помогает уже никакое лекарство, снижает вирусную нагрузку в 88% случаев.
- препарат показывает пикомолярную активность (105 пМ)
- он обладает уникально низким клиренсом, из-за чего задерживается в организме на ПОЛГОДА после разовой дозы! Вы не ослышались - его клиренс 6 месяцев! Надо отметить, что для такой активности рекомендуемая доза достаточно большая - 450мг. Но зато скорость выведения за полгода не может убрать вещество до неактивной концентрации.
Механизм в двух словах: ингибирование правильной работы капсида происходит через активацию образования неправильной пространственной структуры мономеров.
Но в нюансах много интересного. Механизм достаточно долго изучали, и много интересного про устройство самого капсида HIV накопали в процессе. Сначала предполагали, что Ленакапавир не дает слипаться мономерам капсида, затем - что наоборот, стабилизирует капсид так, что он вовремя не распадается и не выпускает генетический материал. На текущий момент выяснено, что мягкий но прочный капсид HIV в цикле размножения вируса должен дотащить содержимое до ядра клетки, и только там он должен высвободить свою РНК. Ленакапавир делает капсид жестким, но при этом хрупким, и капсид разваливается до достижения ядра, а его содержимое переваривается в цитоплазме хоста.
История создания: Пфайзер сначала опубликовал статью, в которой они рассказали про слабо связывающуюся молекулу, да еще и цитотоксичную. Но зато дали рентгеновскую структуру. Дальше ребята из Gilead, на основе ключевого скаффолда придумали новых молекул, проскринили и нашли как активаторы, так и ингибиторы самоорганизации белков капсида. Логику ингибиторов не поняли, они все сильно отличались, но с активаторами работать и делать дизайн было проще и они решили - а почему бы не искать настолько активный активатор, чтоб нормальный капсид образоваться не мог?
В результате, разработанный активатор формирует предпочтительно гексамеры из белков мономеров капсида, при этом образование пентамеров ингибируется. Отдельно гексамеры не могут собраться в нормальный, прочный и мягкий капсид, потому что для правильного обязательно нужны также пентамеры.
В ходе оптимизации попытались снизить выведение. Растворимость Ленакапавира очень низкая, что позволило использовать его как депо-лекформу с частотой в две инъекции в год.
PS: Оригинальная публикация Gilead: тык
#вакансия #хантим
Две отличные вакансии "на вырост".
Ищем химиков-синтетиков.
Желаемый уровень - выпускник (лучше всего - РХТУ, МИТХТ, химфаки но рассмотрят всё) + 1-3 года опыта в синтетической лаборатории после, можно больше. Зарплата по итогам собеседования.
1. Пептидный синтез в АО "Фарм-Синтез". RnD подразделение в Москве. Ведение своей тематики по пептидным векторам доставки. Отличная вакансия начального уровня в отличной проверенной Фарме. Скучно не будет.
контакт, и еще почта: [email protected]
2. Олигосинтез на ФБМФ, Институт Биофизики Будущего в Долгопрудном. Отдельная своя комната, надо будет обустраиваться. Все необходимое для старта по приборной части - олигосинтезаторы и ВЭЖХ. Можно не имея опыта в олигосинтезе, но общий опыт синтетика нужен. Химическое руководство и консультации - в НИИ СБМ, де-юре руководство - в Долгопе.
контакт, еще контакт
Две отличные вакансии "на вырост".
Ищем химиков-синтетиков.
Желаемый уровень - выпускник (лучше всего - РХТУ, МИТХТ, химфаки но рассмотрят всё) + 1-3 года опыта в синтетической лаборатории после, можно больше. Зарплата по итогам собеседования.
1. Пептидный синтез в АО "Фарм-Синтез". RnD подразделение в Москве. Ведение своей тематики по пептидным векторам доставки. Отличная вакансия начального уровня в отличной проверенной Фарме. Скучно не будет.
контакт, и еще почта: [email protected]
2. Олигосинтез на ФБМФ, Институт Биофизики Будущего в Долгопрудном. Отдельная своя комната, надо будет обустраиваться. Все необходимое для старта по приборной части - олигосинтезаторы и ВЭЖХ. Можно не имея опыта в олигосинтезе, но общий опыт синтетика нужен. Химическое руководство и консультации - в НИИ СБМ, де-юре руководство - в Долгопе.
контакт, еще контакт
Коллеги поддержали обсуждение российского производства: #блестящие_железки в Люмипробе.
Forwarded from Галя вам расскажет
... про российские производства для биотеха
Почти в любой молбиол лабе до 2020-х всё, от магнитной мешалки и весов до холодильника с реагентами, пластика и сложного оборудования, было европейских, в основном немецких, и американских брендов. И только неорганические соли стояли в банках с этикеткой "сделано в СССР" еще с 1970-х годов (ну а что им будет-то, как говорится).
Не то, чтобы в России ничего не пытались производить в эти годы, скорее не было особо спроса: запускать производство или делать штучное оборудование дорого и демпинга по цене не выйдет, а качество первых партий часто страдает, поэтому ферменты и олиги для ПЦР российские прижились (там рынок давала медицинская диагностика), а остальное существовало немножко параллельно, почти как "нишевая парфюмерия" для ценителей 😂. Не забываем и о рисках перевода протоколов на новые расходники для конечного пользователя: можно сэкономить на новинке 5 тыс рублей, а потом в помойку выкинуть других реактивов на 500.
Когда доллар был по 40 (олды тут 😎) сидеть на привычном западном было выгодно, по 80 уже не очень, но проще чем переходить на все новое, а с санкциями стало еще дороже и дольше (это при том, что "норма" ожидания поставки всегда была месяца 2-3).
Китайцы тоже не дурачки: очень дешевыми они были, когда качество страдало и выбирали между ними и западом, а сейчас они и уровень продукции подняли, и рынок трезво оценили. Уместна аналогия с китайским автопромом в РФ.
В итоге именно последние годы российское производство значительно приободрилось: потребители вынужденно стали патриотами, да и государство бывает как-то поддержит.
Я на нашу площадку привлекаю в том числе российских производителей, для них у меня всегда отдельное место не только в списке рабочих дел, но и в сердце ❤️😏. А еще больше я люблю посещать производства!
Вот на прошлой неделе побывала в Lumiprobe, ребята находятся в Москве и специализируются на флуоресцентных красителях, но и не только. Такая у них современное и хорошо оснащенное производство, прямо 😍 и полноценный RnD, и поставки сделанного у нас иностранным партнерам.
А еще я теперь знаю отечественных производителей лабораторного и медицинского пластика, наборов для выделения нуклеинок и различной диагностики, производителей антител (кстати, некоторые их давно делали, просто раньше вся партия уходила той же Сигме) создателей российских хроматографов, общелабораторного оборудования и микрофлюидных тест-систем. Ну круто же! Добавлю в комменты ещё примеров с фото)
#биотех
Ну неужели у нас в стране не могут сделать даже... ?
Почти в любой молбиол лабе до 2020-х всё, от магнитной мешалки и весов до холодильника с реагентами, пластика и сложного оборудования, было европейских, в основном немецких, и американских брендов. И только неорганические соли стояли в банках с этикеткой "сделано в СССР" еще с 1970-х годов (ну а что им будет-то, как говорится).
Не то, чтобы в России ничего не пытались производить в эти годы, скорее не было особо спроса: запускать производство или делать штучное оборудование дорого и демпинга по цене не выйдет, а качество первых партий часто страдает, поэтому ферменты и олиги для ПЦР российские прижились (там рынок давала медицинская диагностика), а остальное существовало немножко параллельно, почти как "нишевая парфюмерия" для ценителей 😂. Не забываем и о рисках перевода протоколов на новые расходники для конечного пользователя: можно сэкономить на новинке 5 тыс рублей, а потом в помойку выкинуть других реактивов на 500.
Когда доллар был по 40 (олды тут 😎) сидеть на привычном западном было выгодно, по 80 уже не очень, но проще чем переходить на все новое, а с санкциями стало еще дороже и дольше (это при том, что "норма" ожидания поставки всегда была месяца 2-3).
Китайцы тоже не дурачки: очень дешевыми они были, когда качество страдало и выбирали между ними и западом, а сейчас они и уровень продукции подняли, и рынок трезво оценили. Уместна аналогия с китайским автопромом в РФ.
В итоге именно последние годы российское производство значительно приободрилось: потребители вынужденно стали патриотами, да и государство бывает как-то поддержит.
Я на нашу площадку привлекаю в том числе российских производителей, для них у меня всегда отдельное место не только в списке рабочих дел, но и в сердце ❤️😏. А еще больше я люблю посещать производства!
Вот на прошлой неделе побывала в Lumiprobe, ребята находятся в Москве и специализируются на флуоресцентных красителях, но и не только. Такая у них современное и хорошо оснащенное производство, прямо 😍 и полноценный RnD, и поставки сделанного у нас иностранным партнерам.
А еще я теперь знаю отечественных производителей лабораторного и медицинского пластика, наборов для выделения нуклеинок и различной диагностики, производителей антител (кстати, некоторые их давно делали, просто раньше вся партия уходила той же Сигме) создателей российских хроматографов, общелабораторного оборудования и микрофлюидных тест-систем. Ну круто же! Добавлю в комменты ещё примеров с фото)
#биотех
Forwarded from Галя вам расскажет
Лабы и производство Биолабмикса, Академгородок, Новосибирск
дописываю #заметки_лаовая чтобы закрыть тему с отчетом по Китаю.
часть 3: Поговорим о мифах про Китай.
1. "Социальный рейтинг" - такой штуки не существует в реальности. Добавить нечего. Все вот эти вот +1000 очков социального рейтинга, которые партия начислит мне за этот пост - не более чем шутка. Есть некий кредитный рейтинг алипей, но это вообще не про то, и не в тех масштабах, чем пугают нашего обывателя.
2. "Отсутствие креативности китайцев" - тоже миф, который имеет все таки определенную базу. Действительно часто в рядовых ситуациях обычные китайцы мыслят шаблонно. Но: это не предрасположенность, а результат очень специфического подхода к образованию. Их очень сильно учат мыслить шаблонно. В школе ребенок нарисовал зайчика не строго по образцу, а по своему, творчески - повод для снижения оценки. Несмотря на такую проблему своего образования, тупо за счет большого количества китайцев нехватки в креативных кадрах нет. Жесточайшая конкуренция прямо с детсада, наверх действительно проходят лучшие из лучших.
3. "Китайцы плохо воюют" - не умеют (в этом контексте упоминают остров Даманский), или не хотят («срединное государство», китай обладает наибольшим количеством пригодной для жизни земли, и наибольшим количеством пригодных для сельского хозяйства земли), етс - тоже стереотип. Возможно, даже нарочито поддерживаемый самими китайцами, мол "мы не занимаемся передвижением границ"? К слову, еще как передвигают - см. территориальные претензии в Южно-Китайском море, и передвинут еще в будущем там где будет надо. Да и с воинственностью (плакаты с социальной рекламой армии, плюс очень популярный жанр туризма в России для китайцев - приехать зимой пострелять на полигоне из всякого разного) - порядок. Уважаемый китайский цензор, не поймите неправильно - я же вовсе не возражаю, а наоборот только за!
4. "Бесплатное образование" - его, к удивлению, нет!
Ребенка в школу ты можешь отдать только по распределению исходя из прописки, родился в деревне - учишься в деревне, а не в Шанхае. Если хочешь другую школу - только платно, и стоить может дорого. А после 9 класса бесплатного образования нет, даже по прописке. Но получить образование - главный смысл существования, основной императив. Китаец зарабатывает деньги не потому что просто хочет быть богатым, а потому что богатый может себе позволить образование. Учиться - идея фикс, поэтому хотя в Китае и нет доступного бесплатного образования - за него все равно платят любые деньги. Причем подход к образованию - чем жестче тем лучше: огромные задания, и никакой жизни кроме зубрежки учеников нет. Если школа очень элитная, то там делают некоторые подвижки в сторону поощрения "творческого подхода".
5. "трудолюбие": китайцы не любят просто работу как таковую - они такие же нормальные люди. Они, по меткому выражению Миши "трудостойкие". Там где китаец сохнет, отечественный зумер получит минус вайб, выгорит и сдохнет. Как вам идея иметь шестидневку и 5 дней отпуска в году? Ну ладно, если это ультратоп компания с гуманными HR практиками типа Huawei - то 7.
6. "Китай атеистическое государство" - строго формально да, а по сути совсем нет. Китаец верит в то, что ему выгодно. Отношение к религии примерно как в позднем советском союзе - гайдлайны есть, но в целом на них плевать. Поразило что у китайцев база в которую верят абсолютно все - это культ предков, это же такая классическая глубокая архаика! Одни вероучения и системы легко наслаиваются на другие. Ты можешь быть буддистом, даосистом и при этом почитать предков. Ты можешь приносить жертвы предкам, и при этом быть партийным атеистом. Есть христианские конфессии - католики, православные. Есть исконно-китайский ислам, который произошел от потомков первых арабских купцов, которые еще в средние века посещали Китай и дельту жемчужной реки в частности.
Вместо заключения: Китай огромен, даже как минимум географически. За один раз можно посмотреть только какой-то его кусочек.
Тут есть всё, поэтому никакой стереотип не будет оправдан. Судить о Китае по какой-то его части - все равно что быть слепым в притче про слепых и слона.
часть 3: Поговорим о мифах про Китай.
1. "Социальный рейтинг" - такой штуки не существует в реальности. Добавить нечего. Все вот эти вот +1000 очков социального рейтинга,
2. "Отсутствие креативности китайцев" - тоже миф, который имеет все таки определенную базу. Действительно часто в рядовых ситуациях обычные китайцы мыслят шаблонно. Но: это не предрасположенность, а результат очень специфического подхода к образованию. Их очень сильно учат мыслить шаблонно. В школе ребенок нарисовал зайчика не строго по образцу, а по своему, творчески - повод для снижения оценки. Несмотря на такую проблему своего образования, тупо за счет большого количества китайцев нехватки в креативных кадрах нет. Жесточайшая конкуренция прямо с детсада, наверх действительно проходят лучшие из лучших.
3. "Китайцы плохо воюют" - не умеют (в этом контексте упоминают остров Даманский), или не хотят («срединное государство», китай обладает наибольшим количеством пригодной для жизни земли, и наибольшим количеством пригодных для сельского хозяйства земли), етс - тоже стереотип. Возможно, даже нарочито поддерживаемый самими китайцами, мол "мы не занимаемся передвижением границ"? К слову, еще как передвигают - см. территориальные претензии в Южно-Китайском море, и передвинут еще в будущем там где будет надо. Да и с воинственностью (плакаты с социальной рекламой армии, плюс очень популярный жанр туризма в России для китайцев - приехать зимой пострелять на полигоне из всякого разного) - порядок. Уважаемый китайский цензор, не поймите неправильно - я же вовсе не возражаю, а наоборот только за!
4. "Бесплатное образование" - его, к удивлению, нет!
Ребенка в школу ты можешь отдать только по распределению исходя из прописки, родился в деревне - учишься в деревне, а не в Шанхае. Если хочешь другую школу - только платно, и стоить может дорого. А после 9 класса бесплатного образования нет, даже по прописке. Но получить образование - главный смысл существования, основной императив. Китаец зарабатывает деньги не потому что просто хочет быть богатым, а потому что богатый может себе позволить образование. Учиться - идея фикс, поэтому хотя в Китае и нет доступного бесплатного образования - за него все равно платят любые деньги. Причем подход к образованию - чем жестче тем лучше: огромные задания, и никакой жизни кроме зубрежки учеников нет. Если школа очень элитная, то там делают некоторые подвижки в сторону поощрения "творческого подхода".
5. "трудолюбие": китайцы не любят просто работу как таковую - они такие же нормальные люди. Они, по меткому выражению Миши "трудостойкие". Там где китаец сохнет, отечественный зумер получит минус вайб, выгорит и сдохнет. Как вам идея иметь шестидневку и 5 дней отпуска в году? Ну ладно, если это ультратоп компания с гуманными HR практиками типа Huawei - то 7.
6. "Китай атеистическое государство" - строго формально да, а по сути совсем нет. Китаец верит в то, что ему выгодно. Отношение к религии примерно как в позднем советском союзе - гайдлайны есть, но в целом на них плевать. Поразило что у китайцев база в которую верят абсолютно все - это культ предков, это же такая классическая глубокая архаика! Одни вероучения и системы легко наслаиваются на другие. Ты можешь быть буддистом, даосистом и при этом почитать предков. Ты можешь приносить жертвы предкам, и при этом быть партийным атеистом. Есть христианские конфессии - католики, православные. Есть исконно-китайский ислам, который произошел от потомков первых арабских купцов, которые еще в средние века посещали Китай и дельту жемчужной реки в частности.
Вместо заключения: Китай огромен, даже как минимум географически. За один раз можно посмотреть только какой-то его кусочек.
Тут есть всё, поэтому никакой стереотип не будет оправдан. Судить о Китае по какой-то его части - все равно что быть слепым в притче про слепых и слона.
Forwarded from Алексей Коробков
Кто умножает матрицы, тот умножает скорбь.
Слон – это мышь, изготовленная по госзаказу.
(Роберт Хайнлайн)
(Роберт Хайнлайн)