Могли ли вы представить, что мы будем уничтожать опухоли при помощи бактерий? Нет, не вирусов или каких-нибудь суперсовременных наночастиц, а именно бактерий! 🙂

В статье, недавно опубликованной в Nature, исследователи из Columbia University представили вариант такой бактериальной (!) вакцины для иммунотерапии злокачественных новообразований.

Идея была довольно простой: раз уж было доказано, что бактерии могут модулировать противоопухолевый иммунитет, почему бы не использовать их для доставки антигенов, способных запускать иммунный ответ? Исследователи взяли пробиотический штамм кишечной палочки — ту самую E.coli, которая живет у нас в кишечнике, только штамм другой. Затем встроили в бактерии гены, которые позволяют им вырабатывать неоантигены — антигены, специфичные к конкретной опухоли, — и использовали их в качестве вакцины. Подобные вещи уже проворачивали с вирусными векторами, но для бактериальных векторов этот подход является новым 🙂

Что сделали с бактериями:

1) Удалили протеазные гены Lon и OmpT из пробиотического штамма. Эти протеазы разрушают белки (а нам нужно больше белков, то есть неоантигенов), а также помогают бактериям образовывать защитные капсулы и биопленки, что делает их невидимыми для иммунной системы — сплошные минусы для нас. После удаления этих генов бактерии стали производить больше неоантигенов и стали куда более дружелюбными к нашим фагоцитам (если дружелюбие можно измерить в 4-кратной уязвимости к фагоцитозу).

2) Добавили ген для производства белка листеролизина O (LLO). Этот белок "дырявит" мембрану фаголизосомы, пузырька, в котором бактерии перевариваются после поглощения антигенпрезентирующими клетками (АПК). Благодаря LLO неоантигены выходят в цитозоль, нарезаются на фрагменты в протеосомах и презентуются CD8+ Т-лимфоцитам, активируя их для уничтожения опухолевых клеток.
А те антигены, которые остаются в фаголизосомах, могут быть представлены на молекулах МНС класса II, что позволяет активировать CD4+ Т-хелперы, которые усиливают иммунный ответ, помогая CD8+ Т-клеткам и активируя другие компоненты иммунной системы ⚾️⚾️

Важно отметить: в этом процессе опухолевые клетки не играют активной роли. Они скорее как ничего не подозревающие злодеи в фильме, пока главные герои (наши бактерии) готовят против них заговор. Бактерии и содержащиеся в них неоантигены поглощаются только специализированными АПК, такими как дендритные клетки и макрофаги — частью иммунной системы. Именно они обрабатывают неоантигены из бактерий, после чего выставляют их фрагменты на своей поверхности. Это позволяет Т-клеткам распознать эти антигены и впоследствии атаковать только те клетки (в данном случае — опухолевые), которые несут эти специфические антигены.

Итог (Часть 1):
Мы получаем эффективную систему: бактерии активно поглощаются АПК, неоантигены обрабатываются и выставляются на поверхности АПК в комплексе с MHC. Это запускает мощный Т-клеточный иммунный ответ против опухоли, и всё работает как надо! Но каковы результаты применения этой системы на различных моделях опухолей? Как работает вакцина с метастазами? Об этом — в следующей части! 🙂

📊 Бактериальные векторы доставки неоантигенов для иммунотерапии злокачественных новообразований

(часть 2, начало тут)

Хорошо, систему доставки мы подобрали. А как эту вакцину вводить и что же там с результатами? 🤔
Для испытания вакцины использовали два способа введения: интратуморальное (прямо в опухоль) и внутривенное (через кровоток). Оба метода показали хорошие результаты, которые варьировались в зависимости от типа рака и метода введения.

1) Лечение колоректального рака:
Интратуморальное введение вакцины мышам с опухолями толстой кишки привело к полной регрессии опухолей у 3 из 7 животных. Остальные, конечно, не остались в полном восторге, но всё же продемонстрировали замедление роста опухолей. Это уже что-то, согласитесь.

2) Лечение меланомы:
Внутривенное введение вакцины значительно замедлило рост опухолей. У 72% мышей, получивших вакцину, выживаемость составила 50 дней после введения, тогда как все животные из контрольной группы погибли к 24 или 30 дню.

3) Борьба с метастазами:
Внутривенное введение бактерий способствовало тому, что они воздействовали также и на метастазы, активируя сильный системный иммунный ответ. Это приводило к значительному подавлению роста метастазов и улучшению выживаемости.

Сравнение с традиционной стратегией:
Для сравнения была испытана более традиционная стратегия, основанная на использовании синтетических длинных пептидов (SLP), которые также служат для стимуляции иммунного ответа. Однако бактериальная вакцина оказалась на голову выше: она замедляла рост опухолей значительно лучше и в двух из восьми случаев вызвала полную регрессию, чего SLP-вакцинация достичь не смогла.

— Результаты обнадеживают. Значит, возможно мы наконец изобретём дешевую таблетку от любой опухоли? 🙂
Не совсем. Такие вакцины будут персонализированными. Прежде чем создать вакцину, потребуется секвенирование опухоли пациента для выявления уникальных неоантигенов с помощью биоинформатических методов, а затем конструирование индивидуальных бактериальных вакцин.

— А где подвох? 🙂
Эффективность бактериальных вакцин может варьироваться в зависимости от типа опухоли и иммунного статуса пациента. Более того, есть риск чрезмерного иммунного ответа на белок LLO, заимствованный изначально у листерий (да-да, тех самых бактерий, вызывающих листериоз). Это может отвлечь часть иммунного ответа от неоантигенов и снизить общую эффективность вакцины.

Итак, бактериальные вакцины для лечения опухолевых заболеваний демонстрируют хорошие результаты, но до клинического применения еще предстоит пройти долгий путь 🙂
Требуются дальнейшие исследования, но потенциал значительный. Да, до волшебной таблетки от всех видов рака мы пока не дошли, но персонализированное лечение опухолей становится всё реальнее.

Автор: Олег Данилик

Привет, биомед! 🙂

Мы решили немного переосмыслить свою жизнь, собрать обратку с участников сообщества и понять, что же нам нужно

Нам нужно увидеться с вами на нашей осенней лекции!

Валерия Кузнецова (хирург-стоматолог, научный сотрудник ЦНИИСиЧЛХ) расскажет о том, что происходит в мире регенерации костной ткани, и о преимуществах и «подводных камнях», которые поджидают ученых, работающих в этой сфере. ✍️

🎱Когда : 9 ноября (суббота) в 16:00
❤️Где : Лабхаб
🎱Как попасть : тык на регистрацию
🎱Стоимость : 0 рублей + 75 рублей/час
Продолжительность : 1 час и обсуждение после лекции, где можно будет задать вопросы Валерии и пообщаться с Биомедами

Увидимся в Лабхабе!

Привет, биомед! 🙂

Вчера мы встретились в ЛабХабе, чтобы послушать о современных подходах к регенерации костной ткани. Валерия Кузнецова рассказала о работе своей лаборатории, поделилась соображениями о том, куда стоит двигаться дальше и историями из будней исследователя-патентодержателя 📊

Наша аудитория растет!
Среди слушателей были не только студенты и аспиранты, но и кандидаты наук, заведующие лабораториями🙂

После лекции был небольшой нетворкинг ✨

Если вы хотите большой нетворкинг, то присоединяйтесь к нашему сообществу - смело пишите Лизе (предварительно глянув закреп 🙂), и приходите на Сходки!

Хорошо, что сегодня пятница
Всех с пятницей, биомеды 🙂

Биомедсходка рекомендует! 🙂

Канал Лизы — молекулярного биолога, которая делится захватывающими историями из мира биологии, рассказывает о последних научных открытиях и выкладывает другие увлекательные материалы из области зоологии, генетики, биохимии, биомедицины и не только!

Лиза рассказывает о сложных вещах просто и изящно. Подписывайтесь, чтобы открыть для себя биологию с новой стороны! 🙂

Биомеды повсюду! 🙂

Конференция «Геномика, метагеномика и молекулярная биология микроорганизмов», проводимая на базе Сколтеха - не исключение

Среди участников конференции мы встретилии:

🎱Леру Косс, которая представила постер о пептидах микроорганизмов в кишечнике человека

🎱Мишу Белоусова с работой, посвященной иммунной системе бактерий, а именно - взаимодействию нуклеоид связывающего белка с белком бактериофага

🎱Дашу Морозову с постером о детекции микроРНК на основе комбинации CRISPR/Саs с изотермической амплификацией.
Кстати, у нас есть интервью с ней

🎱Лизу Ухолкину - руководителя Биомедсходки, студентку лаборатории Анализа Метагеномов Сколтеха

Хотите тоже погружаться в науку, вместе ходить на конференции и общаться с единомышленниками - вступайте в наше сообщество!

Для этого смотрите закреп канала и пишите Лизе ✋🤚

Привет, биомед!🙂

На наших Сходках у ребят, которые только начинают путь в науке, часто возникает вопрос, которые связан с оплатой работы.

Мы решили поделиться своим мнением на этот счёт. Поэтому просим биомедов, для которых этот вопрос актуален, пройти небольшой анонимный опрос чисто для статистики и начала разговора🙂

Мы сделали опрос, чтобы понять, что там с деньгами как выглядит распределение среди наших подписчиков, и готовы поделиться своими соображениями по поводу вопроса оплаты работы студентов🙂

Внимание, пост носит рекомендательный характер, все совпадения случайны, а опыт коммуникации с научниками у каждого уникален

В жизни каждого ученого есть период, когда он еще не ученый, но готовится стать им. Имя этому периоду - студенчество. Абсолютно нормально, если вы пробуете себя в разных сферах, изучаете разные темы. Абсолютно нормально, если вы осваиваете разные методики. Что-то получается сразу, что-то получится потом.

Обстановка в науке такова, что у руководителей есть возможность (и желание, что немаловажно) оплачивать лишь тот труд, которые обладает положительным весом. Например, вы, будучи студентом, решили задачу оптимизации протокола, или вы начали на регулярной основе выполнять какое-то действо, нужное лаборатории целиком. Пример из жизни. Одному из админов канала начали платить в тот момент, когда стало понятно, что он может регулярно приходить в лабу и хорошо ухаживать за рыбами. Рыбы были модельным объектом, поддержание их благополучия - труд, обладающий положительным весом.

Важно 📊

Иногда ваш взгляд на вес работы и взгляд вашего научного руководителя могут не совпадать. И такое бывает. Но, как и многие вещи в жизни, здесь все решается простым советским методом диалога и проговариванием вслух всех моментов. Не бойтесь после него брать время подумать, посоветоваться с близкими, знакомыми и обсудить разные взгляды на ситуация. "Ой, мама звонит!" — один из любимых аргументов админов, если нас просят выбрать что-то прямо сейчас.
Еще может быть так, что результат вашей работы приписывался кому-то другому, или, возможно, пришло время обозначить, что вы готовы к более серьезной работе и хотели бы соответствующего к себе отношения. Есть вероятность, что в этот момент вы поймёте, что вам с научным руководителем не совсем по пути, а возможно, от вас хотят развития каких-то дополнительных навыков, и в скором времени вы станете оплачиваемым сотрудником своего коллектива. Вариантов развития диалога масса, но истинный определяется только в момент диалога

NB!

Иногда встречается политика "студент пишет диплом - мы ему не платим". Чаще всего исследовательская дипломная работа является решением одной из исследовательских задач, которые есть в лаборатории → является работой над задачами лаборатории→ является трудом → может быть оплачена

А какие еще варианты есть? 🙂

🎱До сих пор никто не отменил такую вещь как стипендии - для получения иных достаточно иметь хороший средний балл и/или какие-никакие достижения.
🎱Кроме того, вам не могут помешать подрабатывать в лабораториях, занимающихся рутинными процедурами и связанных с клинико-лабораторной диагностикой. Как правило, в таких лабораториях есть четко фиксируемый испытательный срок и установленная в договоре оплата труда.
🎱Ещё один вариант - крупные фармкомпании. Большинство из них устраивают оплачиваемые стажировки, отбор происходит раз в год или полгода
🎱Тяжело, но правда - возможно стоит заняться поиском лаборатории, где моменты оплаты прозрачны. То есть вы знаете какие задачи, вы знаете какой испытательный срок и на что вы можете рассчитывать.

Это все как-то очень страшно, наверно я не готов

Эмоция понятная каждому члену сообщества Сходки. Мы все находимся на какой-то стадии студенчества и все мы обладаем опытом диалога со своими руководителями. Среди нас есть ребята, которые работают в академии, есть ребята, которые работают или работали в индустрии. Если у вас остаются вопросы сомнения - смело пишите их прямо сюда или в личные сообщения админам Сходки

Где найти возможности, которые могут изменить вашу жизнь? 🙂

Год назад один из участников нашего сообщества узнал о программе Global UGRAD через канал StudyGrants.

Это была полностью финансируемая поездка в Америку на полгода. Удалось пройти отбор и стать финалистом, и хотя поездка не состоялась из-за новых ограничений, пример показывает, как важно находить и использовать такие шансы

Канал собирает гранты, стажировки, волонтёрские программы, бесплатные курсы и другие образовательные возможности по всему миру. Многие из нас находили там что-то полезное и интересное, и мы искренне советуем подписаться! 📊

Также канал с возможностями для школьников ✍️

Привет, Биомед!🙂

Сходка растет, и с каждой встречей к нам присоединяется все больше ребят из самых разных сфер науки🙂

Сегодня героиней рубрики "Люди Биомедсходки" стала Марья Рейкина. Мы поговорили о задачах, которые решают маркетологи, работающие в биотехе, и обсудили разницу между работой в академии и в индустрии 📊

Привет, биомед! 🙂

Мы пришли к тебе с анонсом, рассказать, что наша финальная сходка года будет открытой(!) и пройдет за пару дней до Нового Года(!!!)

🎱 28 декабря в 19.00
🎱 Stoy bar

Звучит клёво, как присоединиться ?

Все просто - нужно заполнить форму
В день мероприятия вам придет напоминание о встрече
NB! Если вы понимаете, что не сможете прийти - нужно отменить запись в Timepad

🎱А что в программе?

🌟 Биомеды будут рассказывать о разных вещах - например, о роли диких животных в распространении инфекций, методах иммунотерапии рака
🌟 Своя Игра от Олега
🌟 Спидфрендинг
🌟 Дресс-код: по желанию, приходите в образе тематики своего исследования - это может быть какая-то деталь (флюоресцентная, ярко-зеленая брошь, если вы увлекаетесь белками, которые светятся) или целый образ🙂

Увидимся в субботу!✋🤚