@coronamed

Первые новости о нейтрализации нового варианта, как и прошлой зимой, пришли из лаборатории Блума, где очень молодые ученые делают очень крутые вещи. На этот раз команда Блума применила разработанный ими калькулятор иммунного ускользания:

Мы создали калькулятор, в котором собраны данные глубокого мутационного сканирования, чтобы оценивать, как мутации в RBD SARSCoV2 влияют на распознавание поликлональными антителами человека. Калькулятор подчеркивает обширные антигенные изменения в варианте омикрон.

Калькулятор использует экспериментальные данные о том, как все мутации, возможные в RBD SARSCoV2, влияют на связывание 33 нейтрализующих антител, для расчета антигенных эффектов произвольных комбинаций мутаций в сайте RBD.

Этот подход не является сложным вычислительным алгоритмом черного ящика: это простое агрегирование прямых экспериментальных данных для создания карты связывания поликлональных антител, а затем интуитивный расчет того, как на нее влияют мутации.

Расчеты хорошо коррелируют с исследованиями нейтрализации, проведенными различными группами ученых на вариантах и мутантах SARSCoV2.

Расчеты подтверждают предположения ученых: нейтрализующая способность антител к RBD спайка рухнула туда, где все это время в гордом одиночестве был искусственный полимутантный спайк PMS20 группы Пола Биениаса (в реакциях нейтрализации псевдовирус с PMS20 не смогли нейтрализовать 17 из 21 сыворотки реконвалесцентов и 8 из 14 сывороток вакцинированных мРНК-вакцинами). Что ж, похоже, теперь у него есть настоящий природный друг - наш мягонький омикрон, чудо чудесное и живая вакцина.

Весь тред лаборатории Блума здесь.

Эти новости могут показаться ужасными, но наш канал не занимается фирмонгерством, так что уже несколько дней на случай таких новостей мы носим в кармане большой пузырек успокоительного из одного свежего исследования. Накапаем чуть позже.

Twitter

Bloom Lab

Here’s total calculated RBD antibody binding to Omicron (w/o R346K) & #SARSCoV2 variants. Omicron has much less binding than other variants; is close to artificial spike polymutant PMS20 of @PaulBieniasz @theodora_nyc (9/n)

www.group-telegram.com/no/coronamed.com/2133

6.2K viewsedited  Dec 7, 2021 at 09:31

Первые новости о нейтрализации нового варианта, как и прошлой зимой, пришли из лаборатории Блума, где очень молодые ученые делают очень крутые вещи. На этот раз команда Блума применила разработанный ими калькулятор иммунного ускользания:

Мы создали калькулятор, в котором собраны данные глубокого мутационного сканирования, чтобы оценивать, как мутации в RBD SARSCoV2 влияют на распознавание поликлональными антителами человека. Калькулятор подчеркивает обширные антигенные изменения в варианте омикрон.

Калькулятор использует экспериментальные данные о том, как все мутации, возможные в RBD SARSCoV2, влияют на связывание 33 нейтрализующих антител, для расчета антигенных эффектов произвольных комбинаций мутаций в сайте RBD.

Этот подход не является сложным вычислительным алгоритмом черного ящика: это простое агрегирование прямых экспериментальных данных для создания карты связывания поликлональных антител, а затем интуитивный расчет того, как на нее влияют мутации.

Расчеты хорошо коррелируют с исследованиями нейтрализации, проведенными различными группами ученых на вариантах и мутантах SARSCoV2.

Расчеты подтверждают предположения ученых: нейтрализующая способность антител к RBD спайка рухнула туда, где все это время в гордом одиночестве был искусственный полимутантный спайк PMS20 группы Пола Биениаса (в реакциях нейтрализации псевдовирус с PMS20 не смогли нейтрализовать 17 из 21 сыворотки реконвалесцентов и 8 из 14 сывороток вакцинированных мРНК-вакцинами). Что ж, похоже, теперь у него есть настоящий природный друг - наш мягонький омикрон, чудо чудесное и живая вакцина.

Весь тред лаборатории Блума здесь.

Эти новости могут показаться ужасными, но наш канал не занимается фирмонгерством, так что уже несколько дней на случай таких новостей мы носим в кармане большой пузырек успокоительного из одного свежего исследования. Накапаем чуть позже.

BY @coronamed