На самом деле огромный скелет, бегающий по городу - это японский дух Гашадакуро.

Дух неупокоенного воина обычно. Так что огромная кракозября для Японии - это норма. Скелет мелькает у Миядзаки даже в "тануках" (кадр из мультфильма - второй) .

Картинка, написанная Кустодиевым о событиях восстания на Пресне в Москве могла быть "вдохновлена" столкновением России и Японии ранее во время войны в 1904-1905 годах.