Далее дам краткую информацию по оптимальной настройке для наиболее комфортной игры, которой пользуюсь я. Само собой, если вы уверены в вашем устройстве, у вас есть поле для экспериментов. Благо, все настройки можно сбросить и начать сначала. Учтите, что эмулятор 3DS требует хорошее устройство, поэтому, если у вас лагают игры, появляются задержки звука и т.д., то причины две:
1) Игра плохо эмулируется
2) Слабое устройство

Далее по скриншотам:
1) Место хранения игр в формате .3ds
2) Место хранения игр формата .cia (используйте три точки справа сверху и выбирайте Install CIA для установки игр)
3-5) Мои настройки для комфортной игры.