11 - 14 ноября 2024 года в г. Казани прошла школа-конференция «Современные методы биофизических исследований живых и модельных биологических систем», посвященная современным подходам и инструментам биофизических исследований.
🎓 На конференции с лекциями выступили ведущие ученые, выдающиеся специалисты в области био- и физической химии, а также био- и химической физики.
Среди участников был и наш коллектив:
🎓 Ходов И.А. выступил с содержательной лекцией на тему «Особенности взаимодействия лекарственных соединений с липидной мембраной методом ЯМР», вызвав большой интерес среди слушателей.
📊 Аспирантка Соборнова В.В. и м.н.с. Белов К.В. представили стендовые доклады, продемонстрировав высокое качество научных исследований нашей команды.
Хотим выразить благодарность организаторам за превосходную организацию мероприятия, насыщенную программу и дружественную атмосферу, способствующую плодотворным дискуссиям.
✨ Спасибо за возможность быть частью этого важного события в научном мире! https://bioschool-kazan.ru/
🎓 На конференции с лекциями выступили ведущие ученые, выдающиеся специалисты в области био- и физической химии, а также био- и химической физики.
Среди участников был и наш коллектив:
🎓 Ходов И.А. выступил с содержательной лекцией на тему «Особенности взаимодействия лекарственных соединений с липидной мембраной методом ЯМР», вызвав большой интерес среди слушателей.
📊 Аспирантка Соборнова В.В. и м.н.с. Белов К.В. представили стендовые доклады, продемонстрировав высокое качество научных исследований нашей команды.
Хотим выразить благодарность организаторам за превосходную организацию мероприятия, насыщенную программу и дружественную атмосферу, способствующую плодотворным дискуссиям.
✨ Спасибо за возможность быть частью этого важного события в научном мире! https://bioschool-kazan.ru/
🎉От всей души поздравляем идейного вдохновителя и руководителя нашей лаборатории, доктора физико-математических наук Ходова Илью Анатольевича, с получением ведомственной награды Министерства науки и высшего образования Российской Федерации - Нагрудного знака "Молодой ученый". 🎉
Эта почетная награда является подтверждением Вашего выдающегося вклада в науку, высокого профессионализма и неоценимой роли в развитии нашей лаборатории. Ваш труд, увлеченность и неиссякаемое стремление к постоянному развитию вдохновляют всю команду и служат примером того, как важно работать с полной отдачей.
Пусть эта награда станет еще одной вехой на пути к новым достижениям и успехам в научной деятельности.
Эта почетная награда является подтверждением Вашего выдающегося вклада в науку, высокого профессионализма и неоценимой роли в развитии нашей лаборатории. Ваш труд, увлеченность и неиссякаемое стремление к постоянному развитию вдохновляют всю команду и служат примером того, как важно работать с полной отдачей.
Пусть эта награда станет еще одной вехой на пути к новым достижениям и успехам в научной деятельности.
Дорогие друзья! На прошлой неделе были подведены итоги XI Всероссийской молодежной школы-конфренции "Квантово-химические расчеты: Структура и реакционная способность органических и неорганических молекул".
Результаты работы команды "Fluid State NMR" были представлены студентом Ивановского государственного химико-технологического университета, Алексеем Ковалевым, который в этом году проходит научную практику в нашей лаборатории. В рамках конференции представлены новые результаты, полученные при помощи спектроскопии ядерного эффекта Оверхаузера, по исследованию характеристик пространственной структуры и конформационной подвижности малых молекул нестероидного противовоспалительного препарата - индометацина. Неподдельный интерес Алексея к проводимым исследованиям был отмечен дипломом "За активное участие в работе конференции".
Команда лаборатории поздравляет Алексея! Пусть этот успех станет лишь первым шагом на пути к большим достижениям и новым научным вершинам!🌟👏
Результаты работы команды "Fluid State NMR" были представлены студентом Ивановского государственного химико-технологического университета, Алексеем Ковалевым, который в этом году проходит научную практику в нашей лаборатории. В рамках конференции представлены новые результаты, полученные при помощи спектроскопии ядерного эффекта Оверхаузера, по исследованию характеристик пространственной структуры и конформационной подвижности малых молекул нестероидного противовоспалительного препарата - индометацина. Неподдельный интерес Алексея к проводимым исследованиям был отмечен дипломом "За активное участие в работе конференции".
Команда лаборатории поздравляет Алексея! Пусть этот успех станет лишь первым шагом на пути к большим достижениям и новым научным вершинам!🌟👏
✨ Поздравляем Валентину Соборнову с блестящей победой! ✨
Научно-образовательный центр «АЛГОРИТМ» подвел итоги Всероссийского Конкурса научно-исследовательских работ «Российская наука — 2024» и аспирантка нашей группы Валентина Соборнова одержала победу сразу в нескольких номинациях. Мы гордимся Валентиной и желаем ей новых научных свершений и дальнейших успехов в исследованиях! 🎉https://www.isc-ras.ru/ru/novosti/pobediteli-vserossiyskogo-konkursa-nauchno-issledovatelskih-rabot-rossiyskaya-nauka-2024
Научно-образовательный центр «АЛГОРИТМ» подвел итоги Всероссийского Конкурса научно-исследовательских работ «Российская наука — 2024» и аспирантка нашей группы Валентина Соборнова одержала победу сразу в нескольких номинациях. Мы гордимся Валентиной и желаем ей новых научных свершений и дальнейших успехов в исследованиях! 🎉https://www.isc-ras.ru/ru/novosti/pobediteli-vserossiyskogo-konkursa-nauchno-issledovatelskih-rabot-rossiyskaya-nauka-2024
Недавно опубликованная статья в The Journal of Physical Chemistry Letters исследует динамику обмена воды в пористом кремнеземе с применением методов ЯМР-релаксации. Исследователи впервые использует модель обменно-ориентированной рандомизации (EMOR), которая позволяет количественно оценить влияние обменных процессов между молекулами воды и поверхностью кремнезема на ЯМР релаксацию. В работе варьируется время обмена для молекул H2O и D2O, при помощи добавления фосфата натрия, что позволяет детально изучить, как эти обменные процессы влияют на релаксационные характеристики ЯМР, важные для более точного моделирования взаимодействий воды на поверхностях. https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.4c02590
Топ учёных РФ в области ЯМР-спектроскопии по версии Scopus на 2024 год.
Нас попросили выделить лучших ученых России в области ЯМР-спектроскопии, и для объективности мы опирались на рейтинг Scopus (c 2020-2024). В основу рейтинга легли такие показатели, как: 1 ) Количество публикаций в авторитетных научных журналах.
2) Качество исследований, выраженное в значимости и уровне изданий.
3) Цитируемость.
Мы рады отметить, что первым местом по мнению нашей редакции был удостоен — профессор, ведущий научный сотрудник Лаборатории металлокомплексных и наноразмерных катализаторов ИОХ РАН доктор химических наук Александр Степанович Шашков (h=57).
Один из крупнейших специалистов в области структурной органической и биоорганической химии. Под его руководством были созданы стратегии бездеструктивного анализа сложных органических соединений, что позволило ученым разработать новые лекарственные средства.
С прискорбием сообщаем, что 10 июня 2024 года на 87-м году жизни он скончался.
Нас попросили выделить лучших ученых России в области ЯМР-спектроскопии, и для объективности мы опирались на рейтинг Scopus (c 2020-2024). В основу рейтинга легли такие показатели, как: 1 ) Количество публикаций в авторитетных научных журналах.
2) Качество исследований, выраженное в значимости и уровне изданий.
3) Цитируемость.
Мы рады отметить, что первым местом по мнению нашей редакции был удостоен — профессор, ведущий научный сотрудник Лаборатории металлокомплексных и наноразмерных катализаторов ИОХ РАН доктор химических наук Александр Степанович Шашков (h=57).
Один из крупнейших специалистов в области структурной органической и биоорганической химии. Под его руководством были созданы стратегии бездеструктивного анализа сложных органических соединений, что позволило ученым разработать новые лекарственные средства.
С прискорбием сообщаем, что 10 июня 2024 года на 87-м году жизни он скончался.
Топ учёных РФ в области ЯМР-спектроскопии по версии Scopus на 2024 год
В нашем рейтинге лучших ученых России в области ЯМР-спектроскопии за 2024 год, второе место занял Игорь Валентинович Коптюг (h=46) — доктор химических наук, член-корреспондент РАН, заместитель директора по научной работе Института «Международный томографический центр» СО РАН и руководитель лаборатории магнитно-резонансной томографии. С 2001 года он работает в Международном томографическом центре, где занимается исследованиями мирового уровня.
Он разработал технологию гиперполяризации пропана, что открыло новые возможности для магнитно-резонансных исследований, применил методы магнитно-резонансной томографии для исследования пористых материалов, газообразных углеводородов и работы каталитических реакторов, визуализировал гетерогенные реакции и разработал неинвазивную термометрию с пространственным разрешением.
И.В. Коптюг продолжает вносить значительный вклад в развитие ЯМР-спектроскопии и является одним из ведущих ученых своей области.
В нашем рейтинге лучших ученых России в области ЯМР-спектроскопии за 2024 год, второе место занял Игорь Валентинович Коптюг (h=46) — доктор химических наук, член-корреспондент РАН, заместитель директора по научной работе Института «Международный томографический центр» СО РАН и руководитель лаборатории магнитно-резонансной томографии. С 2001 года он работает в Международном томографическом центре, где занимается исследованиями мирового уровня.
Он разработал технологию гиперполяризации пропана, что открыло новые возможности для магнитно-резонансных исследований, применил методы магнитно-резонансной томографии для исследования пористых материалов, газообразных углеводородов и работы каталитических реакторов, визуализировал гетерогенные реакции и разработал неинвазивную термометрию с пространственным разрешением.
И.В. Коптюг продолжает вносить значительный вклад в развитие ЯМР-спектроскопии и является одним из ведущих ученых своей области.
Уникальный подход к ионному транспорту в полимерных мембранах
Исследователи из Imperial College London и других ведущих университетов представили революционный способ регулирования ионного транспорта через микропоры в полимерных мембранах.
Ученые разработали мембраны, в которых гидрофобные группы регулируют размер пор при их гидратации. Это позволяет точнее управлять транспортом воды и ионов.
⚡️ Мембраны демонстрируют высокую ионную проводимость и значительно сниженную проницаемость для более крупных молекул, что идеально подходит для аккумуляторов нового поколения.
♻️ Разработанная мембрана показала высокую стабильность в органических «редокс»-аккумуляторах, что делает её перспективной для хранения энергии в масштабах энергосистем.
Ученые использовали полимеры с внутренней микропористостью (PIMs) и изменили локальную гидрофобность вблизи заряженных групп. Это позволило создавать «узкие ворота» между микропорами, сохраняя связь водных кластеров и обеспечивая быстрый и эффективный ионный транспорт. Ключом к успеху стало введение ароматических групп, которые уменьшили набухание мембран и улучшили селективность. Подробнее: https://www.nature.com/articles/s41586-024-08140-2
Исследователи из Imperial College London и других ведущих университетов представили революционный способ регулирования ионного транспорта через микропоры в полимерных мембранах.
Ученые разработали мембраны, в которых гидрофобные группы регулируют размер пор при их гидратации. Это позволяет точнее управлять транспортом воды и ионов.
⚡️ Мембраны демонстрируют высокую ионную проводимость и значительно сниженную проницаемость для более крупных молекул, что идеально подходит для аккумуляторов нового поколения.
♻️ Разработанная мембрана показала высокую стабильность в органических «редокс»-аккумуляторах, что делает её перспективной для хранения энергии в масштабах энергосистем.
Ученые использовали полимеры с внутренней микропористостью (PIMs) и изменили локальную гидрофобность вблизи заряженных групп. Это позволило создавать «узкие ворота» между микропорами, сохраняя связь водных кластеров и обеспечивая быстрый и эффективный ионный транспорт. Ключом к успеху стало введение ароматических групп, которые уменьшили набухание мембран и улучшили селективность. Подробнее: https://www.nature.com/articles/s41586-024-08140-2
Nature
Selective ion transport through hydrated micropores in polymer membranes
Nature - A method for design of polymer membranes uses strategically placed pendant groups with specific hydrophobicity to precisely tailor hydrated pore size, with applications in ion-conducting...
Мобильные роботы с ИИ ускоряют химический синтез и анализ ЯМР
Исследователи из Университета Ливерпуля разработали мобильных роботов с ИИ, которые проводят исследования в области химического синтеза значительно быстрее, чем люди. В статье, опубликованной в Nature, учёные показали, что роботы, использующие ИИ для принятия решений, выполняют задачи, такие как проведение реакций, ЯМР анализ продуктов и выбор дальнейших шагов, на уровне человека, но гораздо быстрее.
Эти роботы высотой 1,75 метра выполняют задачи в трёх областях химии, включая структурную диверсификацию и фотохимический синтез. Используя ИИ, они принимают решения, которые обычно занимают часы у человека, за секунды.
Исследование продолжает развитие проекта "мобильного робот-химика", впервые представленного в 2020 году. Эти роботы могут масштабироваться для использования в крупных лабораториях и в будущем помогут ускорить разработки в области фармацевтики и новых материалов. В дальнейшем планируется расширение ИИ, включая интеграцию с научной литературой для улучшения контекстного анализа.
Дополнительная информация: Andrew Cooper, Autonomous mobile robots for exploratory synthetic chemistry, Nature (2024). DOI: 10.1038/s41586-024-08173-7. www.nature.com/articles/s41586-024-08173-7
Видео про работу команды https://youtu.be/dRT3tepdMyI
Исследователи из Университета Ливерпуля разработали мобильных роботов с ИИ, которые проводят исследования в области химического синтеза значительно быстрее, чем люди. В статье, опубликованной в Nature, учёные показали, что роботы, использующие ИИ для принятия решений, выполняют задачи, такие как проведение реакций, ЯМР анализ продуктов и выбор дальнейших шагов, на уровне человека, но гораздо быстрее.
Эти роботы высотой 1,75 метра выполняют задачи в трёх областях химии, включая структурную диверсификацию и фотохимический синтез. Используя ИИ, они принимают решения, которые обычно занимают часы у человека, за секунды.
Исследование продолжает развитие проекта "мобильного робот-химика", впервые представленного в 2020 году. Эти роботы могут масштабироваться для использования в крупных лабораториях и в будущем помогут ускорить разработки в области фармацевтики и новых материалов. В дальнейшем планируется расширение ИИ, включая интеграцию с научной литературой для улучшения контекстного анализа.
Дополнительная информация: Andrew Cooper, Autonomous mobile robots for exploratory synthetic chemistry, Nature (2024). DOI: 10.1038/s41586-024-08173-7. www.nature.com/articles/s41586-024-08173-7
Видео про работу команды https://youtu.be/dRT3tepdMyI
Nature
Autonomous mobile robots for exploratory synthetic chemistry
Nature - A modular autonomous platform for general exploratory synthetic chemistry uses mobile robots to integrate an automated synthesis platform and two analysis platforms.
Топ учёных РФ в области ЯМР-спектроскопии по версии Scopus на 2024 год
Третье место в нашем рейтинге занимает доктор химических наук Александр Григорьевич Степанов (h=44), руководитель группы ЯМР спектроскопии каталитических превращений углеводородов Института катализа им. Г.К. Борескова Сибирского отделения РАН. Основными направлениями научной работы Александра Григорьевича являются: структурная характеристика цеолитных катализаторов и металл-органических каркасов (МОК) с использованием 27Al и 29Si MAS ЯМР, исследование молекулярной подвижности в сложных материалах с использованием 2H ЯМР, а также мониторинг химических реакций на поверхности катализаторов с применением in situ 13С и 1Н MAS ЯМР. Александр Григорьевич опубликовал многочисленные работы, которые высоко оценены как в России, так и за рубежом, и его исследования по праву занимают достойное место в международной научной сфере.
Третье место в нашем рейтинге занимает доктор химических наук Александр Григорьевич Степанов (h=44), руководитель группы ЯМР спектроскопии каталитических превращений углеводородов Института катализа им. Г.К. Борескова Сибирского отделения РАН. Основными направлениями научной работы Александра Григорьевича являются: структурная характеристика цеолитных катализаторов и металл-органических каркасов (МОК) с использованием 27Al и 29Si MAS ЯМР, исследование молекулярной подвижности в сложных материалах с использованием 2H ЯМР, а также мониторинг химических реакций на поверхности катализаторов с применением in situ 13С и 1Н MAS ЯМР. Александр Григорьевич опубликовал многочисленные работы, которые высоко оценены как в России, так и за рубежом, и его исследования по праву занимают достойное место в международной научной сфере.
Улучшение восстановления спектра в ультраскоростной ЯМР с использованием SPEN
В журнале Analytica Chimica Acta опубликована статья, посвященная улучшенному методу восстановления спектра для ультраскоростной "спатиотемпоральной" кодировки (SPEN) в двухмерной ЯМР спектроскопии. Статья, автором которой является группа ученых из Китая и Израиля, обсуждает проблему шума, возникающего при использовании метода переплетенной Фурье-преобразования (FT) для реконструкции спектра, а также предлагает новый метод для его устранения. Предложенный метод реконструкции эффективно использует данные SPEN и значительно улучшает чувствительность спектра. Экспериментальные результаты показывают, что это решение позволяет существенно улучшить качество данных ЯМР, делая их более четкими и легко интерпретируемыми. Это открывает новые возможности для более точного анализа молекулярных структур и компонентных составов в сложных смесях, особенно в исследованиях быстрых реакций. https://doi.org/10.1016/j.aca.2024.343430
В журнале Analytica Chimica Acta опубликована статья, посвященная улучшенному методу восстановления спектра для ультраскоростной "спатиотемпоральной" кодировки (SPEN) в двухмерной ЯМР спектроскопии. Статья, автором которой является группа ученых из Китая и Израиля, обсуждает проблему шума, возникающего при использовании метода переплетенной Фурье-преобразования (FT) для реконструкции спектра, а также предлагает новый метод для его устранения. Предложенный метод реконструкции эффективно использует данные SPEN и значительно улучшает чувствительность спектра. Экспериментальные результаты показывают, что это решение позволяет существенно улучшить качество данных ЯМР, делая их более четкими и легко интерпретируемыми. Это открывает новые возможности для более точного анализа молекулярных структур и компонентных составов в сложных смесях, особенно в исследованиях быстрых реакций. https://doi.org/10.1016/j.aca.2024.343430
Топ учёных РФ в области ЯМР-спектроскопии по версии Scopus на 2024 год
Четвертое место в нашем рейтинге занимает Владимир Васильевич Клочков (h=24), ведущий научный сотрудник, доктор наук и профессор Казанского федерального университета, Института физики. Научная деятельность Владимира Васильевича сосредоточена на исследовании пространственного строения и внутримолекулярной подвижности органических и биоорганических соединений с использованием современных методов ядерного магнитного резонанса (ЯМР). Он разработал методы определения конформационного состава циклических и ациклических молекул на основе низкотемпературных ЯМР спектров 1Н и 13С. Его работы включают изучение конформационных свойств карбо- и гетероциклических соединений, а также определение их пространственной структуры в растворах. Научные достижения Владимира Васильевича Клочкова значительно способствовали развитию ЯМР спектроскопии и пониманию структуры биоорганических молекул.
Четвертое место в нашем рейтинге занимает Владимир Васильевич Клочков (h=24), ведущий научный сотрудник, доктор наук и профессор Казанского федерального университета, Института физики. Научная деятельность Владимира Васильевича сосредоточена на исследовании пространственного строения и внутримолекулярной подвижности органических и биоорганических соединений с использованием современных методов ядерного магнитного резонанса (ЯМР). Он разработал методы определения конформационного состава циклических и ациклических молекул на основе низкотемпературных ЯМР спектров 1Н и 13С. Его работы включают изучение конформационных свойств карбо- и гетероциклических соединений, а также определение их пространственной структуры в растворах. Научные достижения Владимира Васильевича Клочкова значительно способствовали развитию ЯМР спектроскопии и пониманию структуры биоорганических молекул.
Топ учёных РФ в области ЯМР-спектроскопии по версии Scopus на 2024 год
Пятое место в нашем рейтинге занимает Леонид Борисович Кривдин (h=33), профессор, доктор химических наук, главный научный сотрудник. В 1990-1991 годах прошел годичную стажировку в Университете Флиндерса в Южной Австралии в группе профессора Эрнста Делла. В 1989 году он получил степень доктора химических наук, а в 1993 году был удостоен звания профессора.
Научные интересы Леонида Борисовича сосредоточены на вычислении параметров спектров ЯМР, и его достижения в этой области подтверждены более чем 400 исследовательскими публикациями в ведущих мировых химических журналах, а также 15 обзорами и главами в книгах. В настоящее время он работает главным научным сотрудником лаборатории ЯМР Иркутского института химии имени А.Е. Фаворского СО РАН и является заведующим кафедрой химии Ангарского государственного технического университета. Научная деятельность Леонида Борисовича значительно повлияла на развитие ЯМР спектроскопии в России и за рубежом.
Пятое место в нашем рейтинге занимает Леонид Борисович Кривдин (h=33), профессор, доктор химических наук, главный научный сотрудник. В 1990-1991 годах прошел годичную стажировку в Университете Флиндерса в Южной Австралии в группе профессора Эрнста Делла. В 1989 году он получил степень доктора химических наук, а в 1993 году был удостоен звания профессора.
Научные интересы Леонида Борисовича сосредоточены на вычислении параметров спектров ЯМР, и его достижения в этой области подтверждены более чем 400 исследовательскими публикациями в ведущих мировых химических журналах, а также 15 обзорами и главами в книгах. В настоящее время он работает главным научным сотрудником лаборатории ЯМР Иркутского института химии имени А.Е. Фаворского СО РАН и является заведующим кафедрой химии Ангарского государственного технического университета. Научная деятельность Леонида Борисовича значительно повлияла на развитие ЯМР спектроскопии в России и за рубежом.
О научных результатах проекта РНФ
В 2024 году команда проекта 24-23-00318 (Конформационное многообразие как определяющий фактор дизайна новых форм лекарственных соединений) под руководством д.ф.-м.н. Ходова Ильи Анатольевича столкнулась с интересной задачей — разобраться, как молекулы бикалутамида взаимодействуют с модельной липидной мембраной на основе фосфатидилхолина. Это исследование было важным шагом в понимании того, как молекулы лекарств могут влиять на биологические мембраны, что критично для создания более эффективных препаратов.
Для этого использовались современные методы ядерного магнитного резонанса (ЯМР), которые позволили глубже понять особенности молекулярной структуры исследуемых систем. Исследования показали, что молекулы бикалутамида, внедряясь в липидную мембрану, не нарушают её стабильности, а наоборот, могут её немного стабилизировать. Это наблюдение показало, что молекулы антиандрогенного препарата, не всегда разрушают мембраны, как считалось ранее.
Особое внимание было уделено тому, как бикалутамид ведёт себя в разных растворителях. В средах хлороформа и диметилсульфоксида были выявлены два разных конформационных состояния молекулы бикалутамида, которые зависели от полярности растворителя. Это наблюдение подтвердило важность контекста для конформационных характеристик исследуемой молекулы. Так как, молекула может изменять свою конформацию в зависимости от того, в какой части липидного бислоя она находится — в области полярных головок или среди гидрофобных хвостов.
Все эти данные оказались не только интересными с научной точки зрения, но и могут быть полезными для практического применения. Результаты работы уже нашли отражение в статье, опубликованной в International Journal of Molecular Sciences (Q1) https://www.mdpi.com/2889684 , а также в успешной защите диссертаций участниками проекта — Константином Беловым (степень к.х.н.) и Валентиной Соборновой (степень магистра химии).
Этот этап проект стал важным вкладом в изучение взаимодействий активных веществ с биологическими мембранами и может открыть новые горизонты для разработки более эффективных лекарств.
В 2024 году команда проекта 24-23-00318 (Конформационное многообразие как определяющий фактор дизайна новых форм лекарственных соединений) под руководством д.ф.-м.н. Ходова Ильи Анатольевича столкнулась с интересной задачей — разобраться, как молекулы бикалутамида взаимодействуют с модельной липидной мембраной на основе фосфатидилхолина. Это исследование было важным шагом в понимании того, как молекулы лекарств могут влиять на биологические мембраны, что критично для создания более эффективных препаратов.
Для этого использовались современные методы ядерного магнитного резонанса (ЯМР), которые позволили глубже понять особенности молекулярной структуры исследуемых систем. Исследования показали, что молекулы бикалутамида, внедряясь в липидную мембрану, не нарушают её стабильности, а наоборот, могут её немного стабилизировать. Это наблюдение показало, что молекулы антиандрогенного препарата, не всегда разрушают мембраны, как считалось ранее.
Особое внимание было уделено тому, как бикалутамид ведёт себя в разных растворителях. В средах хлороформа и диметилсульфоксида были выявлены два разных конформационных состояния молекулы бикалутамида, которые зависели от полярности растворителя. Это наблюдение подтвердило важность контекста для конформационных характеристик исследуемой молекулы. Так как, молекула может изменять свою конформацию в зависимости от того, в какой части липидного бислоя она находится — в области полярных головок или среди гидрофобных хвостов.
Все эти данные оказались не только интересными с научной точки зрения, но и могут быть полезными для практического применения. Результаты работы уже нашли отражение в статье, опубликованной в International Journal of Molecular Sciences (Q1) https://www.mdpi.com/2889684 , а также в успешной защите диссертаций участниками проекта — Константином Беловым (степень к.х.н.) и Валентиной Соборновой (степень магистра химии).
Этот этап проект стал важным вкладом в изучение взаимодействий активных веществ с биологическими мембранами и может открыть новые горизонты для разработки более эффективных лекарств.
MDPI
Influence of Solvent Polarity on the Conformer Ratio of Bicalutamide in Saturated Solutions: Insights from NOESY NMR Analysis and…
The study presents a thorough and detailed analysis of bicalutamide’s structural and conformational properties. Quantum chemical calculations were employed to explore the conformational properties of the molecule, identifying significant energy differences…
🌟 Новый подход к предсказанию химических свойств с использованием данных ЯМР и машинного обучения 🌟
В недавно опубликованной статье "From NMR to AI: Designing a Novel Chemical Representation to Enhance Machine Learning Predictions of Physicochemical Properties", исследователи из Польши представили инновационный метод для улучшения предсказаний физических и химических свойств молекул, в частности, logD, с помощью машинного обучения. Для анализа использовалась база данных из относительно небольшого количества химических соединений, которые были разделены на 30 кластеров. С помощью таких мощных методов, как Support Vector Regression (SVR), Gradient Boosting и AdaBoost, ученые смогли точно прогнозировать значения logD.
Это исследование подчеркивает потенциал ЯМР как мощного инструмента для создания более точных и эффективных моделей, что, в свою очередь, ускоряет процессы разработки новых препаратов и улучшения их свойств. https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jcim.3c02039
В недавно опубликованной статье "From NMR to AI: Designing a Novel Chemical Representation to Enhance Machine Learning Predictions of Physicochemical Properties", исследователи из Польши представили инновационный метод для улучшения предсказаний физических и химических свойств молекул, в частности, logD, с помощью машинного обучения. Для анализа использовалась база данных из относительно небольшого количества химических соединений, которые были разделены на 30 кластеров. С помощью таких мощных методов, как Support Vector Regression (SVR), Gradient Boosting и AdaBoost, ученые смогли точно прогнозировать значения logD.
Это исследование подчеркивает потенциал ЯМР как мощного инструмента для создания более точных и эффективных моделей, что, в свою очередь, ускоряет процессы разработки новых препаратов и улучшения их свойств. https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jcim.3c02039
Новая публикация: Исследование взаимодействия цикспорина C с ионами Dy3+ в ацетонитриле и в комплексе с мицеллами методом ЯМР спектроскопии
Мы рады представить нашу новую публикацию, посвященную исследованию взаимодействия молекул цикспорина C (CsC) с ионами Dy3+ в двух различных средах — ацетонитриле и в составе мицелл DPC. Для анализа использовались методы ЯМР спектроскопии высокого разрешения, включая одномерные и двумерные техники.
В ходе эксперимента был зафиксирован неоднородный эффект воздействия ионов Dy3+ на различные ЯМР-сигналы CsC.
Результаты этого исследования дополняют более ранние работы, посвященные комплексу CsA-Dy3+ и подтверждают важность таких взаимодействий для понимания структуры и свойств цикспорина в различных растворителях и условиях.
Авторский состав: Артем С. Тарасов, Гузель А. Миннуллина, Сергей В. Ефимов, Полина П. Кобчикова, Илья А. Ходов и Владимир В. Клочков.
Статья доступна по ссылке: https://www.mdpi.com/1422-0067/25/24/13312
Мы рады представить нашу новую публикацию, посвященную исследованию взаимодействия молекул цикспорина C (CsC) с ионами Dy3+ в двух различных средах — ацетонитриле и в составе мицелл DPC. Для анализа использовались методы ЯМР спектроскопии высокого разрешения, включая одномерные и двумерные техники.
В ходе эксперимента был зафиксирован неоднородный эффект воздействия ионов Dy3+ на различные ЯМР-сигналы CsC.
Результаты этого исследования дополняют более ранние работы, посвященные комплексу CsA-Dy3+ и подтверждают важность таких взаимодействий для понимания структуры и свойств цикспорина в различных растворителях и условиях.
Авторский состав: Артем С. Тарасов, Гузель А. Миннуллина, Сергей В. Ефимов, Полина П. Кобчикова, Илья А. Ходов и Владимир В. Клочков.
Статья доступна по ссылке: https://www.mdpi.com/1422-0067/25/24/13312
Топ учёных РФ в области ЯМР-спектроскопии по версии Scopus на 2024 год
Сергей Павлович Бабайлов (h=17) — один из представителей нового поколения специалистов в области ЯМР-спектроскопии, ведущий научный сотрудник Института неорганической химии им. А.В. Николаева СО РАН, доктор химических наук. Он разработал методы анализа строения парамагнитных комплексов лантанидов с помощью ЯМР, исследуя их внутримолекулярную динамику. Его работы включают определение стехиометрического состава комплексных ионных пар, изучение внутримолекулярных динамических процессов, таких как вращение фенильных колец в комплексах с лантанидами. Он впервые выявил закономерности в поведении лантанид-индуцированных расщеплений сигналов и спин-спиновых взаимодействий в комплексов с осмием. Исследования Бабайлова расширяют знания о динамике и структуре лантанидных комплексов и их взаимодействиях.
Принцип выбора кандидатов для составления рейтинга изложен в первом посте: vk.com/wall-116617000_395
Сергей Павлович Бабайлов (h=17) — один из представителей нового поколения специалистов в области ЯМР-спектроскопии, ведущий научный сотрудник Института неорганической химии им. А.В. Николаева СО РАН, доктор химических наук. Он разработал методы анализа строения парамагнитных комплексов лантанидов с помощью ЯМР, исследуя их внутримолекулярную динамику. Его работы включают определение стехиометрического состава комплексных ионных пар, изучение внутримолекулярных динамических процессов, таких как вращение фенильных колец в комплексах с лантанидами. Он впервые выявил закономерности в поведении лантанид-индуцированных расщеплений сигналов и спин-спиновых взаимодействий в комплексов с осмием. Исследования Бабайлова расширяют знания о динамике и структуре лантанидных комплексов и их взаимодействиях.
Принцип выбора кандидатов для составления рейтинга изложен в первом посте: vk.com/wall-116617000_395
Новый взгляд на явление линии Видома в сверхкритической воде. Исследователи из Университета города Лилль, Католического университета прикладных наук имени Кароя Эстерхази и Института химии растворов РАН использовали молекулярно-динамическое моделирование с моделью TIP4P/2005, чтобы изучить структурные свойства воды в диапазоне температур от 300 до 1100 K при давлении от 175 до 375 бар. Они проанализировали параметры локальной структуры воды, такие как тетраэдрическая упорядоченность, расстояние до ближайших соседей, локальная плотность и размер самых плотных доменов. Ученые показали, что экстремальные значения изменений этих параметров позволяют определить линии Видома, полностью согласующиеся с экспериментальными данными. Этот подход подчеркивает важность структурных характеристик для понимания термодинамики сверхкритических жидкостей и открывает новые перспективы в исследовании сложных систем.
https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.4c01142
https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.4c01142
Влияние золотых и платиновых наночастиц на структуру комплексов L-тирозина в водной среде
Наша новая статья, под названием "Interaction of gold and platinum nanoparticles with L-tyrosine in aqueous solution: Conformational and dynamic changes" опубликованная в Journal of Molecular Liquids Q1. В исследовании приняли участие Марк Смирнов аспирант из БФУ, проходивший стажировку в нашей лаборатории и Георгий Гамов из ИГХТУ. Работа посвящена изучению влияния наночастиц золота и платины на структуру и динамические свойства комплексов L-тирозина в водной среде. Было показано, что наночастицы оказывают противоположное воздействие: платина "растягивает" молекулярные комплексы тирозина, а золото — "сжимает" их. Полученные результаты будут полезны в разработке биосовместимых наноматериалов для медицины. Ссылка на статью: https://doi.org/10.1016/j.molliq.2024.126822 (50 days' free access https://authors.elsevier.com/c/1kNPbc8qpeN2m для подписчиков)
Наша новая статья, под названием "Interaction of gold and platinum nanoparticles with L-tyrosine in aqueous solution: Conformational and dynamic changes" опубликованная в Journal of Molecular Liquids Q1. В исследовании приняли участие Марк Смирнов аспирант из БФУ, проходивший стажировку в нашей лаборатории и Георгий Гамов из ИГХТУ. Работа посвящена изучению влияния наночастиц золота и платины на структуру и динамические свойства комплексов L-тирозина в водной среде. Было показано, что наночастицы оказывают противоположное воздействие: платина "растягивает" молекулярные комплексы тирозина, а золото — "сжимает" их. Полученные результаты будут полезны в разработке биосовместимых наноматериалов для медицины. Ссылка на статью: https://doi.org/10.1016/j.molliq.2024.126822 (50 days' free access https://authors.elsevier.com/c/1kNPbc8qpeN2m для подписчиков)