Telegram Group Search
Витамины бактерий

Флавины, представителем которых является витамин B2, являются кофакторами огромного числа ферментов и помогают осуществлять множество окислительно-восстановительных реакций в организмах живых существ.

Но некоторые организмы синтезируют и используют 5-деазафлавины. Они почти идентичны по структуре флавинам, но отличаются тем, что атом азота в центральном кольце молекулы замещен на углерод - отсюда приставка деаза.

Несмотря на то, что отличаются они всего одним атомом, флавины и деазафлавины имеют различия в физико-химических свойствах. Например, флавины люминесцируют желтым светом, а деазафлавины - нежно-голубым.

Также деазафлавины имеют более низкие восстановительные потенциалы, что делает их более сильными восстановителями.

В природе встречается две различные формы деазафлавинов - F0 и F420. Первый выполняет только одну роль у некоторых бактерий - он поглощает свет, передает ее обычному флавину, а уже тот восстанавливает испорченные пиримидиновые основания - таким образом они участвуют в репарации ДНК.

В то время как F420 - уже настоящий бактериальный кофактор, составной элемент ферментов гидрогеназ, ответственный за восстановление двойных CC и CN связей.

Именно деазафлавины ответственны за производство метана в метаногенных бактериях - тех самых, которые тоже виноваты в глобальном потеплении. А еще деазафлавины играют важную роль в биосинтезе некоторых антибиотиков.
Когда в лаборатории мы поделили студентов на babystudent и kidstudent, нам это показалось забавным. Теперь коллеги из @ivoryzoo включили нас самих в папку #kindergarten — подборку совсем юных тг-каналов, посвященных науке.
#пост_по_регламенту

Большая папка каналов от нашего Зоопарка будет завтра, а пока что ловите новую папку #kindergarten - напоминаем, это, как правило, не очень большие каналы, которые: 1) по нашему мнению, могут быть интересны части наших посетителей и 2) при первом ознакомлении кажутся скорее ок (но прям очень далеко не листали).

Посмотрите, выбирайте, добавляйте по вкусу!

https://www.group-telegram.com/addlist/WsTUgH5V-c83ZjMy
Голубой пигмент племени Майя

Маянский голубой - это цвет, который дошел до нас через тысячелетия. Его мы можем увидеть в редких предметах искусства, которые остались от древней цивилизации - фресках, гончарных изделиях, церемониальных артефактах.

Когда ученые пытались понять природу устойчивости цвета - осознали, что это настоящая технология, гибридный материал. Основные компоненты - краситель индиго, который экстрагировали из листьев местного растения Анила и минерал палыгорскит, алюмосиликат магния, который имеет волокнистую и пористую структуру с наноразмерными каналами.

Индиго перемешивали с палыгорскитом и нагревали, и индиго встраивался в структуру минерала так, что оказывался устойчив к биодеградации, солнечному свету, а также к действию высоких температур и даже кислот. На тему того, каким образом молекулы красителя интегрированы с палыгорскитом, еще ведутся дискуссии.

Оригинальный рецепт изготовления пигмента был утерян в ходе истории, поэтому его пришлось заново воспроизводить в 20 веке.

И в 21 веке, вдохновляясь маянским голубым, исследователи пытаются разрабатывать новые экологичные и в то же время стойкие гибридные системы.
Тайное оружие зверобоя

Лето заканчивается, поэтому хочется еще немного внимания уделить летне-цветочной химии.

Гиперицин - ароматическое соединение, производное антрахинона, был впервые выделен из зверобоя в 1939 году. Зверобой вам наверняка попадался где-нибудь в поле - это растение с маленькими желтыми цветами и мелкими листочками, которое очень распространено в средней полосе и активно используется в народной медицине.

Например, зверобой известен как антидепрессант, который помогает в легких и средних случаях заболевания. В результате ряда исследований было показано, что этим он обязан, в частности, гиперицину, который действует на гомеостаз серотонина, регулирует церебральные цитохромы p450 и воздействует на сигнальные пути, ответственные за воспаление в нейронах.

Кроме того гиперицин проявляет противовирусные, противомикробные и фунгицидные свойства. Он оказался эффективным против гепатита B, герпеса, вирусного бронхита и даже Covid 19.

Еще оказалось, что его можно использовать как средство для фотодинамической терапии раковых заболеваний. Для этого он обладает двумя необходимыми свойствами - хорошо аккумулируется в опухолях и является фотосенсибилизатором - активируется под действием видимого света и производит из обычного кислорода активные формы кислорода, которые приводят к гибели раковых клеток. За последние 20 лет вышло много научных публикаций на данную тему.

Но это все к чему - скоро осень. Поэтому если вам попадется букет сушеного зверобоя, то чай заваривать не надо. Лучше залейте его чем-нибудь органическим, организуйте колоночку и выделите гиперицин, осенью он порадует вас своим ярким цветом.
А еще его можно выгодно продать коллегам ученым, на сигма олдрик цены доходят до 400€ за мг.
1871 – Дмитрий Менделеев: свойства химических элементов, а следовательно, и свойства образуемых ими соединений находятся в периодической зависимости от их атомного веса.

1861 – Александр Бутлеров: свойства соединений зависят не только от входящих в его состав химических элементов и их соотношения, но и от молекулярной структуры, то есть от последовательности связывания атомов.

Наши дни – свойства веществ определяются не только молекулярной структурой соединений, но и системой межмолекулярных взаимодействий, которые объединяют молекулы в ансамбли. Супрамолекулярные структуры формируются самопроизвольно из множества комплементарных компонентов, которые на молекулярном уровне хранят информацию о специфических селективных взаимодействиях. Супрамолекулярная агрегация оказывает значительное влияние на свойства материалов, и, управляя ею, можно целенаправленно изменять эти свойства.

Прямо сейчас – в Новосибирске проходит III Международный симпозиум «Нековалентные взаимодействия в синтезе, катализе и кристаллохимическом дизайне»

Изображение — супермолекула по мнению ИИ Кандинский
Катализ лепестками

Когда думаешь о гетерогенных катализаторах, первыми на ум приходят металлы, оксиды, мофы, а вовсе не цветочные лепестки.

Но ученые даже на отдыхе проводят время с пользой для дела. Гуляют по лужайке или по ботаническому саду и вдруг приходит идея: «Ха, так зачем же мне куда-то иммобилизовать мой фотокатализатор, если вот он, готовенький, на клумбе растет».

Вероятно, так и подумали авторы одной статьи из журнала Green Chemistry, и использовали лепестки зверобоя в качестве гетерогенного фотокатализатора для окислительно-восстановительных реакций.

Авторы продемонстрировали, что продукты реакций восстановительного сочетания арилгалогенидов и окислительного сочетания N-арилтетрагидроизохинолинов получаются с хорошими выходами и в мягких условиях за 24 часа при облучении голубым светом.

Также авторы выяснили, что высушенные лепестки обладают фотокаталитической активностью в основном благодаря уже знакомому вам гиперицину.
Ртутные реки императора

По легенде первый китайский император Цинь Шихуанди, который объединил страну в 221 году до нашей эры, похоронен под холмом рядом с городом Сиань в провинции Шэньси. Спустя сто лет Историк Сыма Тянь описывает усыпальницу императора как обширное помещение, облицованное бронзой, с потолками украшенными драгоценными камнями, где находится очень точная модель императорского дворца, вокруг которого располагается столица Сяньян и далее вся империя.

По территории модельного государства протекали сотни великих китайских рек, которые содержали отнюдь не воду, а ртуть. Историк пишет, что течение ртути в реках поддерживалось с помощью специальных механизмов, перекачивающих тяжелую жидкость.

Когда в 1974 году нашли знаменитую терракотовую армию и соотнесли локацию находки с описаниями Сымы Тяня, поняли, что гроб императора должен быть в радиусе километра.

Последующие раскопки позволили понять, что терракотовая армия является только частью большого подземного комплекса и даже идентифицировали курган, где может находиться император, но раскопки приостановили из страха, что могут повредить содержимое, в частности, ртутные реки.

Тем не менее, были проведены различные неинвазивные тесты, в том числе химический анализ почвы, который позволил установить повышенное содержание ртути в непосредственной близости к кургану.

В летописях историка Сымы подземная модель империи была правильно ориентиована, то есть совпадала с реальной географией страны. Исследования установили, что наибольшие содержания ртути совпадали с расположениями китайских морей и дельтой реки Янцзы, косвенно подтверждая легенду.

(из книги «Сказки периодической таблицы» Хью Олдерси-Уильямс; фото с сайта Bridgeman Images)
13 сентября 1892 года состоялась торжественная церемония закладки «Менделеевского центра» — исторического здания химической лаборатории Санкт-Петербургского университета, расположенного во дворе Двенадцати коллегий

Необходимость строительства отдельного здания для проведения лекций по химии и практических занятий в Санкт-Петербургском университете возникла в связи с увеличением учебных часов и недостатком пространства в помещениях Двенадцати коллегий. В конце XIX века химию в университете изучало около 400 студентов ежегодно, среди которых были и юристы, поскольку знание химии было необходимо для работы в Таможенном ведомстве. О важности строительства отдельного здания для химии еще в 1886 году в докладной записке руководству университета писал профессор Д. И. Менделеев, к которому присоединились его коллеги по кафедре химии — А. М. Бутлеров и Н. А. Меншуткин. В этом документе поднимался вопрос о необходимости кардинального преобразования преподавания химии в Петербургском университете, что требовало создания совершенно новой химической лаборатории. Менделеев в своих набросках представил общий проект будущей лаборатории и указал на ее предполагаемую стоимость.

Созданием проекта здания химической лаборатории руководил профессор-химик Н. А. Меншуткин. Автором же этого амбициозного проекта стал академик архитектуры А. Ф. Красовский, прославившийся своими гражданскими постройками в Санкт-Петербурге. Летом 1891 года профессор Меншуткин и архитектор Красовский отправились в заграничное путешествие, чтобы ознакомиться с крупнейшими химическими лабораториями Западной Европы. Они посетили Берлин, Мюнхен, Вену, Будапешт, Цюрих и другие центры высшего образования. Известные ученые, такие как А. В. Гофман в Берлине и А. Байер в Мюнхене, охотно делились своими знаниями с русскими коллегами. При осмотре лабораторий Меншуткин проявлял особое внимание к деталям их организации и оборудования, особенно к устройству вентиляции, отопления и освещения. Таким образом, при разработке архитектурного решения были учтены достижения лучших мировых лабораторий.
Строительство нового здания предъявляло ряд важных требований. В числе первоочередных задач стояла необходимость обеспечить максимальную близость к главному корпусу университета — Двенадцати коллегиям. Кроме того, лаборатория должна была получать достаточное количество естественного света, что можно было достичь лишь при условии, что здание будет свободно стоять, не примыкая к другим сооружениям. В результате обращения к начальству Первого Санкт-Петербургского кадетского корпуса университету был безвозмездно передан участок земли, расположенный на современной северной границе территории Петербургского университета, непосредственно соседствующий с южной стороной Ботанического сада. Архитектор мастерски вписал это внушительное здание в узкое пространство, создав гармоничное сочетание архитектуры.

Наконец, к весне 1892 года проект лаборатории был утвержден и в мае того же года началось долгожданное строительство нового здания химической лаборатории Петербургского университета, 13 сентября состоялась торжественная церемония закладки лаборатории, на которую собрались выдающиеся русские ученые, среди которых был и сам Д. И. Менделеев.

Историческое фото из архива Санкт-Петербургского отделения Российского Химического общества им. Д. И. Менделеева.
Современный вид - фотография О. М. Осмоловской, 2007 год

#химия_в_Петербурге #300летСПбГУ #СПбГУ
#российскаянаука #деньвисториихимии #популяризациянауки
ДНК Сад

В королевском ботаническом саду в Лондоне сейчас проходит выставка работ современного британского художника Марка Куина, который долгое время интересовался взаимосвязями между природой и человечеством.

Одна из работ под названием «ДНК сад» была вдохновлена экспериментами, которые Куин проводил в коллаборации с Нобелевским лауреатом Джоном Салстоном, получившим премию по физиологии и медицине за вклад в секвенирование генома человека.

Работа представляет собой металлический алтарь, на котором расположена серия портретов ДНК, визуализированных и сохраненных на агарозном геле. Среди них 2 ДНК принадлежат натурщикам (или натущицам), а другие 75 – различным видам растений.

В своей работе Куин хотел выразить идею о том, что различные виды живой природы имеют общего предка – одноклеточных амеб, которые жили миллиарды лет назад. ДНК сад - это генетическая библиотека, напоминающая о том, что человек и природа изначально были едины, до тех пор пока эволюционные процессы нас не разделили.
Эпсомская соль

Эпсомская соль, английская соль - это все названия сульфата магния (точнее его семиводного кристаллогидрата).

Согласно легенде, когда-то недалеко от маленького английского города Эпсом местные фермеры заметили, что их скот отказывается пить из некоторых природных источников. Вкус у воды был неприятный, слишком горький, зато если в ней искупаться, оказалось, она отлично расслабляет тело и Эпсом вскоре стал популярным курортом.

В конце 17 века английский ботаник, врач и один из пионеров дактилоскопии Неемия Грю выделил из воды сульфат магния, и эпсомскую соль стали продавать всем желающим. В начале XIX века больница Святого Варфоломея в Лондоне использовала две с половиной тонны Эпсомской соли каждый год. А сейчас это многомилионный, а то и миллиардный бизнес.

В наши дни ванны с солью Эпсома часто применяются для снятия мышечного напряжения, болей в суставах и стресса. Считается, что она улучшает кровообращение и способствует выведению токсинов. Многие годы считалось, что это все благодаря ионам магния, которые проникают трансдермально (магний — ключевой элемент для более чем 300 ферментативных реакций в организме), но этому факту нет строгих научных подтверждений. Собственно в обзоре 2017 года так и написано – мы проанализировали все факты, но…непонятно, как магний проникает и проникает ли.

Основной аргумент против – то, что в клетки магний попадает не диффузией, а с помощью специальных транспортеров магния, которые не функцинируют в клетках ороговевшего верхнего слоя кожи. Но авторы предполагают, что он может попасть внутрь через потовые железы или волосяные фолликулы.

Вообщем, попадает магний или нет, а может дело вовсе и не в магнии, а в сульфатах, но спится после ванны с эпсомской солью и правда хорошо.

Данная статья не носит рекомендательный характер. Всегда читайте инструкцию по применению и список противопоказаний.
19 октября — день джин-тоника

Джин-тоник — это освежающий напиток, состоящий из тоника и джина, история которого уходит корнями в XVIII век, когда он появился в колониальной Индии. В ходе британской экспансии, вызванной богатством природных ресурсов Индии, европейцы столкнулись с малярией — ужасной болезнью, знаний о лечении которой у них не было. В результате болезнь быстро приобрела эпидемический характер. В борьбе с малярией колонизаторы начали употреблять напиток на основе хинина — тоник, который эффективно предотвращал эту болезнь. Однако горький вкус хинина затруднял его употребление, и поэтому его смешивали с сахаром и джином, который в то время служил безопасной альтернативой местной воде.

Известно, что экстракт коры хинного дерева использовались для лечения малярии по крайней мере с 1632 года, и он был завезен в Испанию еще в 1636 году иезуитскими миссионерами. В 1820 году французские исследователи Пьер Жозеф Пеллетье и Жозеф Бенаиме Каванту впервые выделили чистый хинин, дав этому веществу название, основанное на словах местного племени кечуа — quina или quina-quina, что переводится как «кора коры» или «святая кора». К середине XIX века хинин начал широко использоваться в профилактике малярии, и англичане уже использовали около 700 тонн коры хинного дерева ежегодно.

Чтобы избавиться от зависимости от хинного дерева в производстве хинина, Август Гофман в 1849 году, вскоре после назначения его президентом Королевского химического колледжа, обозначил синтез хинина как ближайшую задачу для химиков. В 1850 году Французское фармацевтическое общество объявило премию в 4000 франков тому, кто к 1 января 1851 года получит полфунта синтетического хинина. Однако задача оказалась слишком сложной для химиков того времени, и полный химический синтез хинина был осуществлён лишь в 1944 году американскими учеными Робертом Вудвордом и Уильямом Дерингом. Впоследствии были разработаны более эффективные методы синтеза, но ни один из них не может конкурировать по стоимости с выделением алкалоида из природных источников. Хинное дерево по-прежнему остаётся единственным источником хинина.

Хинин имеет ярко выраженный горький вкус, способствует увеличению секреции желудочного сока и стимулирует аппетит. В средние века его использовали для успокоения и как обезболивающее. В современных тониках содержание хинина значительно ниже исторического — менее 80 мг на литр, а некоторые не содержат его вовсе. Терапевтическая доза хинина составляет около грамма, тогда как смертельная превышает 8 граммов, что делает современный тоник ни лекарством, ни ядом — в отличие от джина.

К слову об Индии: за 200 лет британского правления в Индии доход на душу населения никогда не увеличивался, а во второй половине XIX века сократился вдвое. Политика колонизаторов привела к голоду, унесшему десятки миллионов жизней. В 1901 году средняя продолжительность жизни индийцев составляла 23 года для мужчин и 24 года для женщин, а в 1921 году снизилась до 19 и 21 года соответственно. Во время Второй мировой войны в Индии началась кампания гражданского неповиновения с требованием немедленного ухода британцев. Несмотря на попытки британского правительства заручиться поддержкой индийцев в обмен на обещания независимости, 15 августа 1947 года Британская Индия самостоятельно обрела свободу и разделилась на два доминиона — Индию и Пакистан.

#химия_в_жизни
#историяхимии
#тожехимия
Химия осенних листьев

Только осенью, в пору увядания, листья раскрываются во всей красе.

Первым прощается зеленый пигмент хлорофилл, и обнажает желтые и оранжевые цвета каротеноидов. Они более устойчивые, они всегда там были, под зеленью, ждали коротких дней и холодных ночей, ждали своего часа.

Каротеноиды – это тетратерпены, которые состоят из 8 изопреновых единиц. Их называют каротинами, если они представляют собой «чистые» углеводороды, и называют ксантофиллами, если они содержат в составе кислород.

Виолаксантин, например, это ксантофилл, оранжевый пигмент, который содержится во многих растениях. Его используют как пищевой краситель (Е161е) в Австралии и Новой Зеландии.

Листья некоторых деревьев, например японского красного клена, осенью становятся полностью красными. За это ответственна другая группа пигментов – антоцианы. Предполагается, что их растения синтезирует в качестве защиты от от происходящих на молекулярном уровне разрушений.

Одним из представителей антоцианов является цианидин. В одной работе, опубликованной в Journal of chemical education, студенты из Финляндии собирали осенние листья и экстрагировали из них пигменты. Экстракты были исследованы с помощью жидкостной хроматографии с тандемной масс-спектрометрией. Так вот, цианидин был обнаружен во всех красных листьях, которые они собрали.

Авторы надеятся, что их методика может быть полезна для создания запоминающихся лабораторных работ для школьников и развития сотрудничества с вузами, которые могли бы предоставить свою приборную базу, а заодно привлечь в будущем талантливых студентов.

Если бы у меня была такая лабораторная в школе, было бы здорово.
Клеточные магистрали

Если взглянуть на молекулярную архитектуру животной клетки за пределами привычных клеточной мембраны и ядра, то можно с восхищением увидеть разветвленные пути клеточного скелета.

Цитоскелет - это очень динамичная и часто неуловимая сеть белковых филаментов, которая простирается по всей клетке. Эти белковые филаменты собираются из молекул белковых мономеров и бывают трех видов: актиновые филаменты, промежуточные филаменты и микротрубочки, образующие трехмерную сетку. Цитоскелет поддерживает клетку, придает ей форму, организует органеллы в цитоплазме, а также участвует в транспорте молекул, делении клеток, передаче сигналов и движении клеток. Масштабный пример - мышечные клетки, которые полны организованных «волокон» цитоскелета, обеспечивающие сокращение мышц. Функционально можно представить, что сеть цитоскелета это мышечная, костная, кровеносная и нервная системы клетки в совокупности.

Железнодорожная сеть и толкающая сила, цитоскелет - это буквально система автомобильных дорог внутри клеток. Существует группа «моторных белков», которые могут транспортировать грузы, двигаясь по цитоскелету, подобно множеству маленьких грузовиков, движущихся по внутриклеточной транспортной системе. Самые разные внутриклеточные карго, включая белки, РНК, везикулы и даже целые органеллы, могут перемещаться по клетке, прикреплённые к этим белкам-двигателям.

Любопытно, что некоторые бактерии (например, Listeria) в процессе эволюции научились использовать клеточный цитоскелет для передвижения внутри клетки. Неудивительно, что мутации в цитоскелетных и родственных им белках тесно связаны с некоторыми врожденными заболеваниями, такими как мышечная дистрофия. Предполагается, что дерегуляция цитоскелета может также играть роль в метастазировании рака, и были разработаны некоторые противораковые препараты, нацеленные на белки цитоскелета, например доцетаксел или паклитаксел.

Изображение:
Микроскопическое изображение клетки фибробласта крысы, окрашенной одновременно на микротрубочки (зеленый), актиновые филаменты (синий) и промежуточные филаменты (красный). Изображение взято с обложки книги «The Cytoskeleton», изданной Cold Spring Harbor Laboratory Press.


Источники :
Большой ресурс с примерами
https://open.oregonstate.education/cellbiology/chapter/cytoskeleton/
Для визуализации см. https://www.youtube.com/watch?v=tO-W8mvBa78
Для тех, кто хочет пойти дальше и узнать больше о движении клеток, см. https://www.youtube.com/watch?v=1Hets5N7bKA
Кунсткамере 310 лет

6 декабря отмечается День Кунсткамеры — музея антропологии и этнографии им. Петра Великого Российской академии наук. Годом основания Кунсткамеры считается 1714 год, когда Петр I распорядился о переводе царской библиотеки и коллекции редкостей из Москвы в Санкт-Петербург. Уникальные экспонаты были размещены в одном из помещений Летнего дворца, получившем название «Кунсткамера», что в переводе означает «кабинет редкостей». Строительство специального здания для музея началось в 1718 году.

Десять лет спустя, 8 февраля 1724 года, Петр I осуществил вторую часть своего «академического» проекта — была учреждена Академия наук и Университет. В новом здании на стрелке Васильевского острова разместились Академия наук, музей и библиотека, открывшиеся 6 декабря 1728 года. Поскольку именно здесь начала свою работу Академия наук, это здание стало символом Российской академии наук, и его изображение было вынесено на эмблему РАН.

Кунсткамера — это не только собрание редкостей, но и место, которое вдохновляют на новые открытия.

#историянауки #российскаянаука
#300летРАН #300летСПбГУ #СПбГУ
50 оттенков оксида кобальта

Современные керамисты добавляют в краску оксид кобальта для создания насыщенного синего цвета. Наложение слоев краски в различных вариациях дает богатую палитру оттенков. Эта техника появилась давно, еще в древние времена и с тех пор не потеряла своей актуальности.

Кобальт был идентифицирован в синей стеклянной лампе из Месопотамии, возраст которой датируется 2000 лет до нашей эры, в синем стекле из Древнего Египта, Сирии и Помпеи. Персидские ремесленники в VIII-XIII веках использовали добавки кобальтовой руды при создания низкотемпературных глазурей. По всей видимости, руда содержала кобальтин CoAsS, серебристо-белый минерал с красноватым оттенком, но чаще черный из-за присутствия железа, или эритрин Co3(AsO4)2•8H2O – минерал малинового цвета.

Позже в Китае во время правления династии Юань (1271 – 1368 гг) мастера из Цзиндэчжэня изобрели новый метод работы с керамикой – теперь фарфор, с нанесенным «кобальтовыми» красками рисунком, обжигали при высокой, более 1200 С, температуре. Китайский синий фарфор стал более доступным и популярным во всем мире в XVII-XVIII веках.

Роспись оксидом кобальта использовали голландские мастера при создании Дельфтского фаянса, а в России «синий кобальт» стал визитной карточкой Гжели.

Фото: Керамистка Фелисити Айлиф использует оксид кобальта для росписи своих гигантских ваз.
2024/12/21 03:42:33
Back to Top
HTML Embed Code: