📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 توالییابی کل ژنوم (WGS) و تجزیه و تحلیل نقشهی ژنی نوعی قارچ تجزیهکننده سلولز
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه
اخیرا محققان چینی، موفق شدند که برای اولین بار ژنوم قارچ نادر Pholiota nameko را با استفاده از تکنولوژیهای پیشرفته Illumina و Nanopore توالییابی کنند (WGS). این قارچ که به دلیل خواص تغذیهای و دارویی بالقوه مورد توجه است، دارای ژنهای کلیدی مرتبط با آنزیمهای تجزیهکننده کربوهیدرات (CAZymes) است که در تجزیه پلیساکاریدهای پیچیده مانند لیگنوسلولز نقش مهمی ایفا میکنند.
این پژوهش همچنین تنوع ژنتیکی قابل توجهی در میان گونههای نزدیک Pholiota نشان داد و ساختار ژنوم باز این قارچ، پتانسیل تکامل و سازگاری آن را برجسته کرد. علاوه بر این، ژنهای مرتبط با مکانهای آمیزشی شناسایی شدند.
این یافتهها پایههای مهمی برای اصلاح نژاد، بهینهسازی کشت، و بهرهبرداری از خواص دارویی و تغذیهای آن در کشاورزی پایدار فراهم کرده و راه را برای کاربردهای دارویی آن هموار میکند.
منبع: Jo Fungi
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 توالییابی کل ژنوم (WGS) و تجزیه و تحلیل نقشهی ژنی نوعی قارچ تجزیهکننده سلولز
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه
اخیرا محققان چینی، موفق شدند که برای اولین بار ژنوم قارچ نادر Pholiota nameko را با استفاده از تکنولوژیهای پیشرفته Illumina و Nanopore توالییابی کنند (WGS). این قارچ که به دلیل خواص تغذیهای و دارویی بالقوه مورد توجه است، دارای ژنهای کلیدی مرتبط با آنزیمهای تجزیهکننده کربوهیدرات (CAZymes) است که در تجزیه پلیساکاریدهای پیچیده مانند لیگنوسلولز نقش مهمی ایفا میکنند.
این پژوهش همچنین تنوع ژنتیکی قابل توجهی در میان گونههای نزدیک Pholiota نشان داد و ساختار ژنوم باز این قارچ، پتانسیل تکامل و سازگاری آن را برجسته کرد. علاوه بر این، ژنهای مرتبط با مکانهای آمیزشی شناسایی شدند.
این یافتهها پایههای مهمی برای اصلاح نژاد، بهینهسازی کشت، و بهرهبرداری از خواص دارویی و تغذیهای آن در کشاورزی پایدار فراهم کرده و راه را برای کاربردهای دارویی آن هموار میکند.
منبع: Jo Fungi
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 شش روند کلیدی بیوتکنولوژی در سال ۲۰۲۵ به گفتهی Sequence Biotech
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
سایت Sequence Biotech در گزارش جدید خود، شش روند مهم را که آیندهی بیوتکنولوژی را در سال ۲۰۲۵ شکل میدهند، معرفی کرده است:
1️⃣ هوش مصنوعی در بیوتکنولوژی: سرعتبخشیدن به کشف دارو و تشخیص بیماریها با کمک یادگیری ماشین.
2️⃣ پیشرفتهای ویرایش ژنتیکی: نوآوریهای جدید در CRISPR برای درمان بیماریهای ژنتیکی و سرطان.
3️⃣ پزشکی دقیق و درمانهای شخصیسازیشده (Precision Medicine & Personalized Therapies): استفاده از ژنومیکس برای بهینهسازی درمانها و کاهش عوارض جانبی.
4️⃣ زیستتولید پایدار: تولید محصولات زیستی با کاهش ضایعات و استفاده از منابع تجدیدپذیر.
5️⃣ رشد استارتاپهای بیوتکنولوژی: افزایش نوآوری در حوزههای پزشکی بازساختی و تحقیقات میکروبیوم.
6️⃣ بیوتکنولوژی در سلامت جهانی: پیشرفت در توسعهی واکسنها و مقابله با بیماریهای عفونی.
منبع: Sequence Biotech
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
سایت Sequence Biotech در گزارش جدید خود، شش روند مهم را که آیندهی بیوتکنولوژی را در سال ۲۰۲۵ شکل میدهند، معرفی کرده است:
1️⃣ هوش مصنوعی در بیوتکنولوژی: سرعتبخشیدن به کشف دارو و تشخیص بیماریها با کمک یادگیری ماشین.
2️⃣ پیشرفتهای ویرایش ژنتیکی: نوآوریهای جدید در CRISPR برای درمان بیماریهای ژنتیکی و سرطان.
3️⃣ پزشکی دقیق و درمانهای شخصیسازیشده (Precision Medicine & Personalized Therapies): استفاده از ژنومیکس برای بهینهسازی درمانها و کاهش عوارض جانبی.
4️⃣ زیستتولید پایدار: تولید محصولات زیستی با کاهش ضایعات و استفاده از منابع تجدیدپذیر.
5️⃣ رشد استارتاپهای بیوتکنولوژی: افزایش نوآوری در حوزههای پزشکی بازساختی و تحقیقات میکروبیوم.
6️⃣ بیوتکنولوژی در سلامت جهانی: پیشرفت در توسعهی واکسنها و مقابله با بیماریهای عفونی.
منبع: Sequence Biotech
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
Sequence BioTech
Biotech Trends 2025: Shaping the Future of Innovation — Sequence BioTech
Learn about the emerging trends in biotechnology, from advanced therapeutics to sustainable innovations shaping 2025.
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 کشف ژن مسئول رنگ نارنجی در گربههای کالیکو و لاکپشتی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه
مطالعهای جدید نشان داد که رنگ نارنجی در گربهها با یک حذف (Deletion) ۵.۱ کیلوبازی در ژن ARHGAP36 روی کروموزوم X مرتبط است. این ژن مسیر ملانین سیاه را مهار کرده و تولید فیوملانین نارنجی را تقویت میکند.
پس از توالییابی کل ژنوم (WGS) و نهایتا بررسی ژنوم ۱۸ گربه انتخاب شده و اندازه گیری بیان ژن آنها با روش RNA-seq، نشان داد که این حذف ژنی ۱۰۰٪ با رنگ نارنجی ارتباط دارد (P = 2.2e−16).
متیلاسیون DNA تأیید کرد که غیرفعالسازی تصادفی کروموزوم X باعث ایجاد الگوی موزاییکی در مادهها میشود.همچنین تحلیل تطبیقی نشان داد که این مکانیسم در انسان و موش نیز دیده میشود.
این پژوهش، ARHGAP36 را بهعنوان O-locus گربههای خانگی شناسایی و نقش آن را در رنگبندی گربهها مشخص کرد.
منبع: bioRxiv
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 کشف ژن مسئول رنگ نارنجی در گربههای کالیکو و لاکپشتی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه
مطالعهای جدید نشان داد که رنگ نارنجی در گربهها با یک حذف (Deletion) ۵.۱ کیلوبازی در ژن ARHGAP36 روی کروموزوم X مرتبط است. این ژن مسیر ملانین سیاه را مهار کرده و تولید فیوملانین نارنجی را تقویت میکند.
پس از توالییابی کل ژنوم (WGS) و نهایتا بررسی ژنوم ۱۸ گربه انتخاب شده و اندازه گیری بیان ژن آنها با روش RNA-seq، نشان داد که این حذف ژنی ۱۰۰٪ با رنگ نارنجی ارتباط دارد (P = 2.2e−16).
متیلاسیون DNA تأیید کرد که غیرفعالسازی تصادفی کروموزوم X باعث ایجاد الگوی موزاییکی در مادهها میشود.همچنین تحلیل تطبیقی نشان داد که این مکانیسم در انسان و موش نیز دیده میشود.
این پژوهش، ARHGAP36 را بهعنوان O-locus گربههای خانگی شناسایی و نقش آن را در رنگبندی گربهها مشخص کرد.
منبع: bioRxiv
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
bioRxiv
A deletion at the X-linked ARHGAP36 gene locus is associated with the orange coloration of tortoiseshell and calico cats
The X-linked orange ( O ) locus in domestic cats controls an unknown molecular mechanism that causes the suppression of black-brownish pigmentation in favor of orange coloration. The alternating black-brownish and orange patches seen in tortoiseshell and…
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 چگونه سگهای چرنوبیل در محیط رادیواکتیوی زنده ماندند؟
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۵ ثانیه
این مطالعه نشان میدهد که سگهای ولگرد چرنوبیل، پس از دههها قرار گرفتن در معرض تشعشعات، تغییرات ژنتیکی تطبیقی پیدا کردهاند. دانشمندان با تحلیل ژنوم آنها، ۳۹۱ ناحیه غیرمعمول شناسایی کردند که احتمالاً با ترمیم DNA و افزایش مقاومت سلولی مرتبط است. این یافتهها میتوانند به درک اثرات تشعشعات بر ژنوم انسان و حیوانات کمک کنند و تاثیر فشار انتخاب بر تطبیق و تکامل موجودات در شرایط بخصوص محیطی را روشنتر سازند.
منبع: Canine Medicine and Genetics
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 چگونه سگهای چرنوبیل در محیط رادیواکتیوی زنده ماندند؟
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۵ ثانیه
این مطالعه نشان میدهد که سگهای ولگرد چرنوبیل، پس از دههها قرار گرفتن در معرض تشعشعات، تغییرات ژنتیکی تطبیقی پیدا کردهاند. دانشمندان با تحلیل ژنوم آنها، ۳۹۱ ناحیه غیرمعمول شناسایی کردند که احتمالاً با ترمیم DNA و افزایش مقاومت سلولی مرتبط است. این یافتهها میتوانند به درک اثرات تشعشعات بر ژنوم انسان و حیوانات کمک کنند و تاثیر فشار انتخاب بر تطبیق و تکامل موجودات در شرایط بخصوص محیطی را روشنتر سازند.
منبع: Canine Medicine and Genetics
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
GENETIX
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی 📢 ساخت سلولهای مجازی هوشمصنوعی (AI Virtual Cells) ⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه دانشمندان در حال توسعهی AIVCs هستند. مدلهای شبکه عصبی پیشرفتهای که میتوانند رفتار پیچیده مولکولها، سلولها و بافتها را شبیهسازی کنند. با استفاده…
💻 اخبار علمی و پژوهشی
📢 سلول مجازی با هوش مصنوعی؛ آغاز عصر In Silico در بیولوژی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۵ ثانیه
دانشمندان با استفاده از هوش مصنوعی در حال توسعه نخستین سلول مجازی انسان هستند، مدلی که میتواند رفتار سلولی را شبیهسازی کند. این پروژه، زیستشناسی را از روشهای وقت گیر و پرهزینهی آزمایشگاهی (In Vitro) به مدلسازی دیجیتالی (In Silico) منتقل میکند و امکان انجام آزمایشهای بینهایت دقیق و کمهزینه را فراهم میآورد. البته یکی از چالشهای بزرگ برای انجام آن، نیاز به ذخیرهسازی و پردازش حجم عظیمی از دادههای زیستی است.
بهعنوان مثال، دادههای زیستی ذخیرهشده در Short Read Archive، اکنون بیش از ۱۴ پتابایت حجم دارد که هزار برابر بزرگتر از مجموعه دادههای مورد استفاده برای آموزش مدلهای هوش مصنوعی پیشرفته مانند ChatGPT است.
در نهایت، این فناوری امکان شبیهسازی واکنش سلولها به داروها، تحلیل جهشهای ژنتیکی، و توسعه نسخههای دیجیتال از بیماران (Digital Twins) را فراهم میکند. با کاهش هزینه و زمان تحقیقات، سلول مجازی میتواند مسیر کشف داروهای جدید و درمان بیماریها را متحول کند و مانند پروژه ژنوم انسان، نقطه عطفی در علم زیستشناسی باشد.
✍️ اندرو مایرز
منبع: Phys.org
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 سلول مجازی با هوش مصنوعی؛ آغاز عصر In Silico در بیولوژی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۵ ثانیه
دانشمندان با استفاده از هوش مصنوعی در حال توسعه نخستین سلول مجازی انسان هستند، مدلی که میتواند رفتار سلولی را شبیهسازی کند. این پروژه، زیستشناسی را از روشهای وقت گیر و پرهزینهی آزمایشگاهی (In Vitro) به مدلسازی دیجیتالی (In Silico) منتقل میکند و امکان انجام آزمایشهای بینهایت دقیق و کمهزینه را فراهم میآورد. البته یکی از چالشهای بزرگ برای انجام آن، نیاز به ذخیرهسازی و پردازش حجم عظیمی از دادههای زیستی است.
بهعنوان مثال، دادههای زیستی ذخیرهشده در Short Read Archive، اکنون بیش از ۱۴ پتابایت حجم دارد که هزار برابر بزرگتر از مجموعه دادههای مورد استفاده برای آموزش مدلهای هوش مصنوعی پیشرفته مانند ChatGPT است.
در نهایت، این فناوری امکان شبیهسازی واکنش سلولها به داروها، تحلیل جهشهای ژنتیکی، و توسعه نسخههای دیجیتال از بیماران (Digital Twins) را فراهم میکند. با کاهش هزینه و زمان تحقیقات، سلول مجازی میتواند مسیر کشف داروهای جدید و درمان بیماریها را متحول کند و مانند پروژه ژنوم انسان، نقطه عطفی در علم زیستشناسی باشد.
✍️ اندرو مایرز
منبع: Phys.org
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
phys.org
Scientists call for all-out, global effort to create an AI virtual cell
Noting that recent advances in artificial intelligence and the existence of large-scale experimental data about human biology have reached a critical mass, a team of researchers from Stanford University, ...
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 تحولی در ژنتیک فضایی: تصویربرداری عمقی RNA و پروتئینها با cycleHCR
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۰ ثانیه
تکنیک cycle Hybridization Chain Reaction محدودیتهای تصویربرداری فلورسنت را با ترکیب DNA barcoding چندمرحلهای و واکنش زنجیرهای هیبریداسیونی (HCR) رفع کرده و امکان تصویربرداری همزمان از RNA و پروتئینها را در بافتهای عمقی فراهم میکند.
با استفاده از این روش، نقشهبرداری سهبعدی دقیق از بیان ژنی در جنین موش تا عمق ۳۱۰ میکرومتر ممکن شد. ترکیب cycleHCR با expansion microscopy ساختارهای زیرسلولی پیچیدهای را آشکار کرده و در برشهای هیپوکامپ موش، الگوهای بیانی و تغییرات ساختاری اختصاصی سلولها را نمایان ساخت.
منبع: Science
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 تحولی در ژنتیک فضایی: تصویربرداری عمقی RNA و پروتئینها با cycleHCR
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۰ ثانیه
تکنیک cycle Hybridization Chain Reaction محدودیتهای تصویربرداری فلورسنت را با ترکیب DNA barcoding چندمرحلهای و واکنش زنجیرهای هیبریداسیونی (HCR) رفع کرده و امکان تصویربرداری همزمان از RNA و پروتئینها را در بافتهای عمقی فراهم میکند.
با استفاده از این روش، نقشهبرداری سهبعدی دقیق از بیان ژنی در جنین موش تا عمق ۳۱۰ میکرومتر ممکن شد. ترکیب cycleHCR با expansion microscopy ساختارهای زیرسلولی پیچیدهای را آشکار کرده و در برشهای هیپوکامپ موش، الگوهای بیانی و تغییرات ساختاری اختصاصی سلولها را نمایان ساخت.
منبع: Science
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 کشف ارتباطات سلولی با استفاده از ترنسکریپتومیکس فضایی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
درک ارتباط سلول-سلول (CCC) کلید فهم سازماندهی و عملکرد بافتها است، جایی که بیان یک لیگاند در یک سلول و گیرنده متناظر آن در سلول همجوار، نقش مهمی در تنظیم فرآیندهای زیستی ایفا میکند. فناوریهای جدید مانند Xenium، MERSCOPE، CosMx، seqFISH و Slide-seqV2 امکان پیشبینی این ارتباطات را فراهم کردهاند.
ادغام محاسباتی دادههای ترنسکریپتومیکس فضایی با دادههای تکسلولی RNA-seq راهی نوین برای بهبود تحلیلهای CCC ارائه میدهد. در این راستا، الگوریتم NiCo با ایجاد یک ماتریس همسایگی، تمام موارد هممکانی سلولهای مختلف را شناسایی کرده و بهطور دقیق قدرت تعاملات سلولی را پیشبینی میکند. این پیشبینیها، که از طریق دادههای شبیهسازیشده تأیید شدهاند، به دانشمندان اجازه میدهد تا الگوهای سازمانی سلولها و نقش عملکردی آنها را در محیطهای بافتی بهتر درک کنند.
منبع: Nature Reviews Genetics
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 کشف ارتباطات سلولی با استفاده از ترنسکریپتومیکس فضایی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
درک ارتباط سلول-سلول (CCC) کلید فهم سازماندهی و عملکرد بافتها است، جایی که بیان یک لیگاند در یک سلول و گیرنده متناظر آن در سلول همجوار، نقش مهمی در تنظیم فرآیندهای زیستی ایفا میکند. فناوریهای جدید مانند Xenium، MERSCOPE، CosMx، seqFISH و Slide-seqV2 امکان پیشبینی این ارتباطات را فراهم کردهاند.
ادغام محاسباتی دادههای ترنسکریپتومیکس فضایی با دادههای تکسلولی RNA-seq راهی نوین برای بهبود تحلیلهای CCC ارائه میدهد. در این راستا، الگوریتم NiCo با ایجاد یک ماتریس همسایگی، تمام موارد هممکانی سلولهای مختلف را شناسایی کرده و بهطور دقیق قدرت تعاملات سلولی را پیشبینی میکند. این پیشبینیها، که از طریق دادههای شبیهسازیشده تأیید شدهاند، به دانشمندان اجازه میدهد تا الگوهای سازمانی سلولها و نقش عملکردی آنها را در محیطهای بافتی بهتر درک کنند.
منبع: Nature Reviews Genetics
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
💻 اخبار علمی و پژوهشی
📢 نوع جدید کنترل بر RNA Splicing
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه
در نوع جدیدی از کنترل در RNA Splicing، اینترونهای غیرکدکننده از پیشRNA حذف و اگزونهای کدکننده به هم متصل میشوند. اسپلایسینگ جایگزین (تولید چند پروتیین توسط یک ژن)نقشی مهمی در تنوع سلولی، سازگاری و بیماریها ایفا میکند.
مکانیسمهای تنظیمی: کشف پروتئینها یا RNAهای غیرکدکنندهای که انتخابهای اسپلایسینگ را در شرایط استرس، رشد یا در بافتهای خاص تنظیم میکنند.
ارتباط با بیماریها: نقص در اسپلایسینگ با اختلالات عصبی (مانند آلزایمر) و سرطانها مرتبط است؛ جهش در فاکتورهای اسپلایسینگ (مانند SF3B1) میتواند موجب پیشرفت تومور شود.
پتانسیل درمانی: استفاده از الیگونوکلئوتیدهای آنتیسنس یا مولکولهای کوچک برای اصلاح اسپلایسینگ ناقص در بیماریهای ژنتیکی.
پیشرفتهای فناورانه: بهرهگیری از ابزارهای CRISPR یا مدلهای مبتنی بر هوش مصنوعی برای پیشبینی نتایج اسپلایسینگ و طراحی درمانهای دقیق.
✍️ دانشگاه MIT
منبع: Phys.org
مقاله: Nature Communications
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 نوع جدید کنترل بر RNA Splicing
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه
در نوع جدیدی از کنترل در RNA Splicing، اینترونهای غیرکدکننده از پیشRNA حذف و اگزونهای کدکننده به هم متصل میشوند. اسپلایسینگ جایگزین (تولید چند پروتیین توسط یک ژن)نقشی مهمی در تنوع سلولی، سازگاری و بیماریها ایفا میکند.
مکانیسمهای تنظیمی: کشف پروتئینها یا RNAهای غیرکدکنندهای که انتخابهای اسپلایسینگ را در شرایط استرس، رشد یا در بافتهای خاص تنظیم میکنند.
ارتباط با بیماریها: نقص در اسپلایسینگ با اختلالات عصبی (مانند آلزایمر) و سرطانها مرتبط است؛ جهش در فاکتورهای اسپلایسینگ (مانند SF3B1) میتواند موجب پیشرفت تومور شود.
پتانسیل درمانی: استفاده از الیگونوکلئوتیدهای آنتیسنس یا مولکولهای کوچک برای اصلاح اسپلایسینگ ناقص در بیماریهای ژنتیکی.
پیشرفتهای فناورانه: بهرهگیری از ابزارهای CRISPR یا مدلهای مبتنی بر هوش مصنوعی برای پیشبینی نتایج اسپلایسینگ و طراحی درمانهای دقیق.
✍️ دانشگاه MIT
منبع: Phys.org
مقاله: Nature Communications
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 ترنسکریپتومیکسِ تکسلولی در طی عفونت PRRSV با حدت متفاوت در خوک
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
مطالعهای جدید در کره، با استفاده از RNA-seqتکسلولی، به بررسی واکنش ایمنی در ریهی خوکهای آلوده به ویروس PRRS پرداخته است. PRRSV، به دلیل تنوع ژنتیکی گسترده و تفاوت در حدت (Virulence)، یکی از چالشهای بزرگ صنعت دامپروری است. یافتهها نشان میدهد که گونههای با حدت زیاد این ویروس باعث آسیب زودهنگام و شدید ریه شده و با کاهش چشمگیر ماکروفاژها و افزایش لنفوسیتها همراه است. در این شرایط، کمتر از ۵٪ ماکروفاژها مستقیماً آلوده شدهاند، اما مرگ سلولی گسترده و از طریق اگزوزومهای حاوی miRNA رخ داده است. در مقابل، عفونتهای با شدت متوسط، آسیب ریوی را با تاخیر و تغییرات ایمنی کمتر نشان دادهاند.
یکی از یافتههای کلیدی این پژوهش، حضور ماکروفاژهای ضدالتهابی M2 (SPP1-CXCL14high) در عفونتهای کمخطر بود که احتمالاً در ترمیم و بهبود ریه نقش دارند؛ عاملی که در عفونتهای شدید مشاهده نشد.
منبع: Nature Communications
#R
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 ترنسکریپتومیکسِ تکسلولی در طی عفونت PRRSV با حدت متفاوت در خوک
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
مطالعهای جدید در کره، با استفاده از RNA-seqتکسلولی، به بررسی واکنش ایمنی در ریهی خوکهای آلوده به ویروس PRRS پرداخته است. PRRSV، به دلیل تنوع ژنتیکی گسترده و تفاوت در حدت (Virulence)، یکی از چالشهای بزرگ صنعت دامپروری است. یافتهها نشان میدهد که گونههای با حدت زیاد این ویروس باعث آسیب زودهنگام و شدید ریه شده و با کاهش چشمگیر ماکروفاژها و افزایش لنفوسیتها همراه است. در این شرایط، کمتر از ۵٪ ماکروفاژها مستقیماً آلوده شدهاند، اما مرگ سلولی گسترده و از طریق اگزوزومهای حاوی miRNA رخ داده است. در مقابل، عفونتهای با شدت متوسط، آسیب ریوی را با تاخیر و تغییرات ایمنی کمتر نشان دادهاند.
یکی از یافتههای کلیدی این پژوهش، حضور ماکروفاژهای ضدالتهابی M2 (SPP1-CXCL14high) در عفونتهای کمخطر بود که احتمالاً در ترمیم و بهبود ریه نقش دارند؛ عاملی که در عفونتهای شدید مشاهده نشد.
منبع: Nature Communications
#R
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
💻 اخبار علمی و پژوهشی
📢 مدل جدید یادگیری عمیق مایکروسافت برای ساخت پروتئین: BioEmu-1
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۰ ثانیه
پژوهشگران مایکروسافت مدل یادگیری عمیق BioEmu-1 را معرفی کردهاند که میتواند هزاران ساختار پروتئینی را در هر ساعت، تنها با استفاده از یک GPU تولید کند. این مدل، برخلاف روشهای محاسباتی سنتی مانند شبیهسازی دینامیک مولکولی (MD) که بسیار هزینهبر و زمانبر هستند، از مدلهای انتشار (Diffusion Models) برای شبیهسازی تعادل ساختاری پروتئینها استفاده میکند.
در حال حاضر، BioEmu-1 بر پروتئینهای منفرد تمرکز دارد، اما در آینده میتواند برای مدلسازی پروتئینهای غشایی، کمپلکسهای چندپروتئینی و شرایط محیطی متنوعتر گسترش یابد. این مدل یک ابزار قدرتمند برای اکتشاف دارو و مهندسی پروتئین فراهم میکند.
✍ آسوین آک
منبع: MarkTechPost
مقاله: bioRxiv
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 مدل جدید یادگیری عمیق مایکروسافت برای ساخت پروتئین: BioEmu-1
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۰ ثانیه
پژوهشگران مایکروسافت مدل یادگیری عمیق BioEmu-1 را معرفی کردهاند که میتواند هزاران ساختار پروتئینی را در هر ساعت، تنها با استفاده از یک GPU تولید کند. این مدل، برخلاف روشهای محاسباتی سنتی مانند شبیهسازی دینامیک مولکولی (MD) که بسیار هزینهبر و زمانبر هستند، از مدلهای انتشار (Diffusion Models) برای شبیهسازی تعادل ساختاری پروتئینها استفاده میکند.
در حال حاضر، BioEmu-1 بر پروتئینهای منفرد تمرکز دارد، اما در آینده میتواند برای مدلسازی پروتئینهای غشایی، کمپلکسهای چندپروتئینی و شرایط محیطی متنوعتر گسترش یابد. این مدل یک ابزار قدرتمند برای اکتشاف دارو و مهندسی پروتئین فراهم میکند.
✍ آسوین آک
منبع: MarkTechPost
مقاله: bioRxiv
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 وکتورهای حلقوی: جایگزینی بدون سلول برای پلازمیدها در ویرایش ژنوم با CRISPR–Cas9
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه
در ویرایش ژنوم با Cas9، بیان موثر gRNA برای حصول نتیجه مطلوب ضروری است. روشهای سنتی معمولاً به پلازمیدهای پیچیدهای نیاز دارند که فرآیند آمادهسازی آنها بسیار زمانبر بوده و شامل کلونینگ باکتریایی، خالصسازی و توالییابی است.
پروتکل وکتور حلقوی یک روش کاملاً سنتتیک و بدون سلول ارائه میدهد که امکان آمادهسازی سریع و کارآمد الگوهای بیان gRNA را بدون نیاز به پلازمیدهای باکتریایی فراهم میکند. در این روش، DNA خطی که حاوی عناصر مورد نیاز برای بیان gRNA است،در عرض ۳ ساعت به DNA حلقوی فشرده و عاری از باکتریالبکبون تبدیل میشود.
ویژگیهای کلیدی این روش شامل موارد زیر است:
حذف کامل اندوتوکسینهای باکتریایی و حذف آلودگیهای احتمالی ناشی از RNA و DNA باکتریایی.
کاهش زمان آمادهسازی از چند روز به چند ساعت.
طراحی بهینه برای بیان gRNA در ویرایش ژنوم از طریق Base Editing و Prime Editing.
منبع: Nature Protocols
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 وکتورهای حلقوی: جایگزینی بدون سلول برای پلازمیدها در ویرایش ژنوم با CRISPR–Cas9
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۴۰ ثانیه
در ویرایش ژنوم با Cas9، بیان موثر gRNA برای حصول نتیجه مطلوب ضروری است. روشهای سنتی معمولاً به پلازمیدهای پیچیدهای نیاز دارند که فرآیند آمادهسازی آنها بسیار زمانبر بوده و شامل کلونینگ باکتریایی، خالصسازی و توالییابی است.
پروتکل وکتور حلقوی یک روش کاملاً سنتتیک و بدون سلول ارائه میدهد که امکان آمادهسازی سریع و کارآمد الگوهای بیان gRNA را بدون نیاز به پلازمیدهای باکتریایی فراهم میکند. در این روش، DNA خطی که حاوی عناصر مورد نیاز برای بیان gRNA است،در عرض ۳ ساعت به DNA حلقوی فشرده و عاری از باکتریالبکبون تبدیل میشود.
ویژگیهای کلیدی این روش شامل موارد زیر است:
حذف کامل اندوتوکسینهای باکتریایی و حذف آلودگیهای احتمالی ناشی از RNA و DNA باکتریایی.
کاهش زمان آمادهسازی از چند روز به چند ساعت.
طراحی بهینه برای بیان gRNA در ویرایش ژنوم از طریق Base Editing و Prime Editing.
منبع: Nature Protocols
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 تحلیل دقیقتر و شفافسازی پیچیدگیهای بیان ژنی با sciRED
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
محققان یک مدل جدید به نام Single-Cell Interpretable Residual Decomposition یا sciRED را توسعه دادهاند که قابلیت تفسیر نتایج تحلیل تکسلولی را افزایش میدهد. این روش با حذف اثرات مخدوشکننده، چرخشهای ریاضی برای بهبود وضوح فاکتورها و ارتباط دادن آنها به متغیرهای شناختهشده، امکان شناسایی الگوهای زیستی پنهان را فراهم میکند (روشهای تفکیک عوامل دادهای (factorization) میتوانند سیگنالهای زیستی را از نویز جدا کنند، اما تفسیر این عوامل همچنان نیازمند تحلیل دستی است).
کاربردهای sciRED در چندین مجموعه داده تأیید شده است:
در کلیه، الگوهای بیان ژنی وابسته به جنسیت را شناسایی کرده است.
در سلولهای ایمنی (PBMC)، تفاوت بین سیگنالهای قوی و ضعیف تحریک ایمنی را مشخص کرده است.
در کبد انسان و موش، آلودگی RNA محیطی را کاهش داده، امضای نادر انواع سلولی را آشکار کرده و برنامههای بیانی مرتبط با نواحی آناتومیکی را تفکیک کرده است.
منبع: Nature
#R
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 تحلیل دقیقتر و شفافسازی پیچیدگیهای بیان ژنی با sciRED
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
محققان یک مدل جدید به نام Single-Cell Interpretable Residual Decomposition یا sciRED را توسعه دادهاند که قابلیت تفسیر نتایج تحلیل تکسلولی را افزایش میدهد. این روش با حذف اثرات مخدوشکننده، چرخشهای ریاضی برای بهبود وضوح فاکتورها و ارتباط دادن آنها به متغیرهای شناختهشده، امکان شناسایی الگوهای زیستی پنهان را فراهم میکند (روشهای تفکیک عوامل دادهای (factorization) میتوانند سیگنالهای زیستی را از نویز جدا کنند، اما تفسیر این عوامل همچنان نیازمند تحلیل دستی است).
کاربردهای sciRED در چندین مجموعه داده تأیید شده است:
در کلیه، الگوهای بیان ژنی وابسته به جنسیت را شناسایی کرده است.
در سلولهای ایمنی (PBMC)، تفاوت بین سیگنالهای قوی و ضعیف تحریک ایمنی را مشخص کرده است.
در کبد انسان و موش، آلودگی RNA محیطی را کاهش داده، امضای نادر انواع سلولی را آشکار کرده و برنامههای بیانی مرتبط با نواحی آناتومیکی را تفکیک کرده است.
منبع: Nature
#R
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
💻 اخبار علمی و پژوهشی
📢 نسل جدید حسگرهای زیستی سریع و چندبارمصرف؛ DNA Origami
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۱۵ ثانیه
محققان با استفاده از DNA Origami، حسگرهای زیستی جدیدی برای تشخیص سریع و چندبارمصرف پروتئینها و DNA توسعه دادهاند که نیاز به آزمایشگاه را کاهش داده و هزینهها را کم میکند. این حسگرها شامل ساختارهای نانویی لالهآبی (Lilypad) متصل به الکترود طلا هستند که در حضور بیومارکر، سیگنال الکتریکی قوی تولید میکنند. وجود ۷۰ مولکول گزارشگر دقت بالایی ایجاد کرده و حسگرها بهراحتی برای تشخیص بیماریهای مختلف تنظیم میشوند.
✍ دانشگاه Aalto
منبع: Phys.org
مقاله: ACS
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 نسل جدید حسگرهای زیستی سریع و چندبارمصرف؛ DNA Origami
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۱۵ ثانیه
محققان با استفاده از DNA Origami، حسگرهای زیستی جدیدی برای تشخیص سریع و چندبارمصرف پروتئینها و DNA توسعه دادهاند که نیاز به آزمایشگاه را کاهش داده و هزینهها را کم میکند. این حسگرها شامل ساختارهای نانویی لالهآبی (Lilypad) متصل به الکترود طلا هستند که در حضور بیومارکر، سیگنال الکتریکی قوی تولید میکنند. وجود ۷۰ مولکول گزارشگر دقت بالایی ایجاد کرده و حسگرها بهراحتی برای تشخیص بیماریهای مختلف تنظیم میشوند.
✍ دانشگاه Aalto
منبع: Phys.org
مقاله: ACS
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 شواهدی بر تکاملِ تکاملپذیری!
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
محققان برای اولین بار شواهد تجربی ارائه دادهاند که نشان میدهد انتخاب طبیعی میتواند نهتنها برای بقا در لحظه، بلکه برای افزایش ظرفیت تکامل در آینده نیز عمل کند.
در آزمایشی سهساله روی جمعیتهای میکروبی آزمایشگاهی، پژوهشگران مشاهده کردند که لُکوسهای (loci) فوقجهشپذیر (hyper-mutable) در برخی از این جمعیتها تکامل یافتند. این مناطق جهشپذیر نرخ جهشی تا ۱۰,۰۰۰ برابر بیشتر از سایر قسمتهای ژنوم داشتند و امکان تغییرات سریع و برگشتپذیر بین حالات فنوتیپی مختلف (برخلاف تصور قدیمی که معتقد بود تکامل فرایندی کورکورانه است) را فراهم میکردند—مشابه مکانیزمهایی که در باکتریهای بیماریزا دیده میشود.
انتخاب در سطح تبارهای میکروبی (lineage-level selection) میتواند ویژگیهایی را که ظرفیت تکاملی را افزایش میدهند، تقویت کند. به بیان دیگر، تکامل میتواند بهنوعی "پیشبینیگر" باشد و به موجودات این امکان را بدهد که برای تغییرات محیطی آینده آماده شوند.
منبع: Science
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 شواهدی بر تکاملِ تکاملپذیری!
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
محققان برای اولین بار شواهد تجربی ارائه دادهاند که نشان میدهد انتخاب طبیعی میتواند نهتنها برای بقا در لحظه، بلکه برای افزایش ظرفیت تکامل در آینده نیز عمل کند.
در آزمایشی سهساله روی جمعیتهای میکروبی آزمایشگاهی، پژوهشگران مشاهده کردند که لُکوسهای (loci) فوقجهشپذیر (hyper-mutable) در برخی از این جمعیتها تکامل یافتند. این مناطق جهشپذیر نرخ جهشی تا ۱۰,۰۰۰ برابر بیشتر از سایر قسمتهای ژنوم داشتند و امکان تغییرات سریع و برگشتپذیر بین حالات فنوتیپی مختلف (برخلاف تصور قدیمی که معتقد بود تکامل فرایندی کورکورانه است) را فراهم میکردند—مشابه مکانیزمهایی که در باکتریهای بیماریزا دیده میشود.
انتخاب در سطح تبارهای میکروبی (lineage-level selection) میتواند ویژگیهایی را که ظرفیت تکاملی را افزایش میدهند، تقویت کند. به بیان دیگر، تکامل میتواند بهنوعی "پیشبینیگر" باشد و به موجودات این امکان را بدهد که برای تغییرات محیطی آینده آماده شوند.
منبع: Science
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
💻 اخبار علمی و پژوهشی
📢 نقش دور از انتظار RNA در ترمیم DNA
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۱۵ ثانیه
تحقیقات دانشمندان آلمانی نشان داده است که NEAT1 RNA نقش مهمی در ترمیم DNA ایفا میکند. زمانی که شکستهای دو رشتهای DNA رخ میدهد، NEAT1 متیلهشده با m6A در محل آسیب تجمع کرده و فرآیند ترمیم را از طریق متیلترانسفراز METTL3 و هلیکاز CHD4 تقویت میکند.
✍ دانشگاه Würzburg
منبع: SciTexhDaily
مقاله: Genes and Development
#R
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 نقش دور از انتظار RNA در ترمیم DNA
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۱۵ ثانیه
تحقیقات دانشمندان آلمانی نشان داده است که NEAT1 RNA نقش مهمی در ترمیم DNA ایفا میکند. زمانی که شکستهای دو رشتهای DNA رخ میدهد، NEAT1 متیلهشده با m6A در محل آسیب تجمع کرده و فرآیند ترمیم را از طریق متیلترانسفراز METTL3 و هلیکاز CHD4 تقویت میکند.
✍ دانشگاه Würzburg
منبع: SciTexhDaily
مقاله: Genes and Development
#R
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
💻 اخبار علمی و پژوهشی
📢 روش BOOST: روش سریع برای گسترش ۱۰ برابری نمونههای زیستی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۱۵ ثانیه
روش Expansion Microscopy با گسترش فیزیکی نمونههای زیستی، وضوح تصویربرداری را افزایش میدهد، اما روشهای فعلی زمانبر هستند. در سال ۲۰۲۵، محققان روش BOOST را معرفی کردهاند، روشی که با استفاده از واکنشهای شیمیایی تسریعشده با مایکروویو، در کمتر از ۹۰ دقیقه گسترش ۱۰ برابری نمونهها، از جمله بافتهای FFPE و نمونههای سهبعدی بزرگ را امکانپذیر میکند.
منبع: Nature Communications
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 روش BOOST: روش سریع برای گسترش ۱۰ برابری نمونههای زیستی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۱۵ ثانیه
روش Expansion Microscopy با گسترش فیزیکی نمونههای زیستی، وضوح تصویربرداری را افزایش میدهد، اما روشهای فعلی زمانبر هستند. در سال ۲۰۲۵، محققان روش BOOST را معرفی کردهاند، روشی که با استفاده از واکنشهای شیمیایی تسریعشده با مایکروویو، در کمتر از ۹۰ دقیقه گسترش ۱۰ برابری نمونهها، از جمله بافتهای FFPE و نمونههای سهبعدی بزرگ را امکانپذیر میکند.
منبع: Nature Communications
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
💻 اخبار علمی و پژوهشی
📢 افزایش پروتئینهای مرتبط با پیری مغز در ۵۷، ۷۰ و ۷۸ سالگی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۰ ثانیه
محققان با بررسی اسکنهای مغزی ۱۱ هزار نفر و سطح پروتئینهای خون در پنجهزار شرکتکننده، ۱۳ پروتئین مرتبط با پیری مغز را شناسایی کردند. برخی از این پروتئینها با التهاب و استرس سلولی افزایش یافته و برخی دیگر که در بازسازی سلولی و حفظ عملکرد مغز نقش دارند، کاهش مییابند.
یکی از مهمترین آنها برویکان (brevican) است که کاهش آن با زوال عقل و سکته مغزی مرتبط است. محققان دریافتند که غلظت این پروتئینها در سنین ۵۷، ۷۰ و ۷۸ سالگی به اوج میرسد. این یافتهها که در Nature Aging منتشر شدهاند، میتوانند به درک بهتر فرآیند پیری مغز کمک کنند، اما تحقیقات بیشتری برای بررسی کاربرد درمانی آنها مورد نیاز است.
✍ امیلی کوک
منبع: LiveScience
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 افزایش پروتئینهای مرتبط با پیری مغز در ۵۷، ۷۰ و ۷۸ سالگی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۰ ثانیه
محققان با بررسی اسکنهای مغزی ۱۱ هزار نفر و سطح پروتئینهای خون در پنجهزار شرکتکننده، ۱۳ پروتئین مرتبط با پیری مغز را شناسایی کردند. برخی از این پروتئینها با التهاب و استرس سلولی افزایش یافته و برخی دیگر که در بازسازی سلولی و حفظ عملکرد مغز نقش دارند، کاهش مییابند.
یکی از مهمترین آنها برویکان (brevican) است که کاهش آن با زوال عقل و سکته مغزی مرتبط است. محققان دریافتند که غلظت این پروتئینها در سنین ۵۷، ۷۰ و ۷۸ سالگی به اوج میرسد. این یافتهها که در Nature Aging منتشر شدهاند، میتوانند به درک بهتر فرآیند پیری مغز کمک کنند، اما تحقیقات بیشتری برای بررسی کاربرد درمانی آنها مورد نیاز است.
✍ امیلی کوک
منبع: LiveScience
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📚 #مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 ژن نئاندرتالها و تأثیر آن بر دندانهای انسان مدرن
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
تحقیقات منتشرشده در ژورنال Cell نشان میدهد که یکی از ژنهای تأثیرگذار بر شکل دندانهای انسان مدرن مستقیماً از نئاندرتالها به ارث رسیده است. بررسی دادههای ۸۸۲ داوطلب از گروههای اروپایی، بومی آمریکا و آفریقایی با استفاده از روش multiomics و یادگیری ماشین نشان داد که این واریانت نئاندرتالی، که بیان ژن PITX2 را تنظیم میکند، تنها در افراد با اجداد اروپایی یافت میشود.
این ژن موجب نازکتر و کوچکتر شدن دندانهای پیشین (incisors) در حاملان آن شده است. کشف این واریانت میتواند در آینده به درمانهای ژنتیکی برای مشکلات دندانی کمک کند.
این یافتهها تأیید میکنند که برخی ویژگیهای انسان مدرن، مانند شکل بینی، حساسیت به درد و اکنون شکل دندانها، تحت تأثیر آمیزش با نئاندرتالها قرار گرفتهاند.
منبع: Cell
#R
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup
📢 ژن نئاندرتالها و تأثیر آن بر دندانهای انسان مدرن
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه
تحقیقات منتشرشده در ژورنال Cell نشان میدهد که یکی از ژنهای تأثیرگذار بر شکل دندانهای انسان مدرن مستقیماً از نئاندرتالها به ارث رسیده است. بررسی دادههای ۸۸۲ داوطلب از گروههای اروپایی، بومی آمریکا و آفریقایی با استفاده از روش multiomics و یادگیری ماشین نشان داد که این واریانت نئاندرتالی، که بیان ژن PITX2 را تنظیم میکند، تنها در افراد با اجداد اروپایی یافت میشود.
این ژن موجب نازکتر و کوچکتر شدن دندانهای پیشین (incisors) در حاملان آن شده است. کشف این واریانت میتواند در آینده به درمانهای ژنتیکی برای مشکلات دندانی کمک کند.
این یافتهها تأیید میکنند که برخی ویژگیهای انسان مدرن، مانند شکل بینی، حساسیت به درد و اکنون شکل دندانها، تحت تأثیر آمیزش با نئاندرتالها قرار گرفتهاند.
منبع: Cell
#R
📧 [email protected]
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup