Ivan Begtin

В рубрике как это устроено у них порталы данных эпидемиологических исследований, для них существует специальное ПО с открытым кодом Obiba Mica [1], я в прошлом году упоминал [2] портал с данными по COVID-19, но это далеко не единственный такой проект с данными.

На базе Obiba Mica работает несколько десятков порталов данных в рамках проектов RECAP Preterm [3], европейский проект мониторинга детей с недостаточным весом и рождённых до срока и EUCAN Connect [4] совместные проекты Евросоюза и Канады в области персонализированной и превентивной медицины. Инсталляции на базе Obiba Mica разбросаны по разным странам: Испания [5], Португалия [6] и многие другие.

В чём особенность этих порталов? Во первых они не содержат открытые данные. Практически всегда содержащиеся там данные - это медицинские сведения, даже если они деперсонализированы, они более всего похожи на микроданные переписей и также организованы.

У датасетов есть переменные и метаданные которые детально описаны, доступны, стандартизированы, но сами данные доступны только после регистрации, направления запроса и получения подтверждения.

И, конечно, это продукт с открытым исходным кодом [7].

Во многих научных дисциплинах есть специализированные продукты/каталоги данных используемых для доступа к данным исследований в форме специфичной для этой дисциплины и Obiba Mica - это один из таких примеров.

В реестре Dateno есть около 20 дата порталов на базе Obiba Mica, в дикой среде их ещё где-то столько же, но в индексе Dateno их нет, поскольку данные из таких каталогов недоступны, а есть только метаданные. А это снижает приоритет индексирования, не говоря уже о том что наборов данных в таких порталах немного, от единиц до пары сотен датасетов.

Ссылки:
[1] https://www.obiba.org/pages/products/mica/
[2] https://www.group-telegram.com/ye/begtin.com/5053
[3] https://recap-preterm.eu/
[4] https://eucanconnect.com/
[5] https://coral.igtp.cat/pub/
[6] https://recap-ispup.inesctec.pt/pub/
[7] https://github.com/obiba

#opendata #datacatalogs #datasets #dateno #microdata #epidemiology

www.group-telegram.com/ye/begtin.com/6286

1.1K viewsIvan Begtin, edited  Dec 19 at 06:03

В рубрике как это устроено у них порталы данных эпидемиологических исследований, для них существует специальное ПО с открытым кодом Obiba Mica [1], я в прошлом году упоминал [2] портал с данными по COVID-19, но это далеко не единственный такой проект с данными.

На базе Obiba Mica работает несколько десятков порталов данных в рамках проектов RECAP Preterm [3], европейский проект мониторинга детей с недостаточным весом и рождённых до срока и EUCAN Connect [4] совместные проекты Евросоюза и Канады в области персонализированной и превентивной медицины. Инсталляции на базе Obiba Mica разбросаны по разным странам: Испания [5], Португалия [6] и многие другие.

В чём особенность этих порталов? Во первых они не содержат открытые данные. Практически всегда содержащиеся там данные - это медицинские сведения, даже если они деперсонализированы, они более всего похожи на микроданные переписей и также организованы.

У датасетов есть переменные и метаданные которые детально описаны, доступны, стандартизированы, но сами данные доступны только после регистрации, направления запроса и получения подтверждения.

И, конечно, это продукт с открытым исходным кодом [7].

Во многих научных дисциплинах есть специализированные продукты/каталоги данных используемых для доступа к данным исследований в форме специфичной для этой дисциплины и Obiba Mica - это один из таких примеров.

В реестре Dateno есть около 20 дата порталов на базе Obiba Mica, в дикой среде их ещё где-то столько же, но в индексе Dateno их нет, поскольку данные из таких каталогов недоступны, а есть только метаданные. А это снижает приоритет индексирования, не говоря уже о том что наборов данных в таких порталах немного, от единиц до пары сотен датасетов.

Ссылки:
[1] https://www.obiba.org/pages/products/mica/
[2] https://www.group-telegram.com/ye/begtin.com/5053
[3] https://recap-preterm.eu/
[4] https://eucanconnect.com/
[5] https://coral.igtp.cat/pub/
[6] https://recap-ispup.inesctec.pt/pub/
[7] https://github.com/obiba

#opendata #datacatalogs #datasets #dateno #microdata #epidemiology

BY Ivan Begtin