@coronamed

Новости штаммобесия: юарец-2.

Позавчера в недрах гисэйда Том Пикок нашел очень сильно мутировавшего потомка B.1.1. - 3 сиквенса из Ботсваны и 1 из Гонконга (у пациента, вернувшегося из Южной Африки). Вариант сидит на очень длинной ветви филогенетического дерева - как и в случае альфы ученые считают это признаком того, что вариант возник у пациента с иммунодефицитом или иммуносупрессией, хронически инфицированного SARS-CoV-2.

Мутации в спайке: A67V, Δ69-70, T95I, G142D/Δ143-145, Δ211/L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F

Мутации вне спайка: NSP3 – K38R, V1069I, Δ1265/L1266I, A1892T; NSP4 – T492I; NSP5 – P132H; NSP6 – Δ105-107, A189V; NSP12 – P323L; NSP14 – I42V; E – T9I; M – D3G, Q19E, A63T; N – P13L, Δ31-33, R203K, G204R

Ко вчерашнему дню этот вариант получил наименование B.1.1.529, сиквенсов в базе уже более 10.

К сегодняшнему дню есть веские основания думать, что именно он стоит за скачком заболеваемости в южноафриканской провинции Гаутенг (Йоханнесбург, Претория), вспышкой ковида в Университете Претории и резким ростом числа новых случаев ковида в ЮАР (1275 новых случаев за последние сутки, из них 1018 в Гаутенге, основной рост в группе 10-29 лет). 100% найденных ноябрьских сиквенсов из провинции Гаутенг - вариант B.1.1.529. Как минимум один из образцов нового варианта получен от вакцинированного с ковидом, еще один заболевший - младенец.

Слайды и больше деталей ниже⬇️

www.group-telegram.com/ye/coronamed.com/1971

5.3K viewsedited  Nov 25, 2021 at 12:01

Новости штаммобесия: юарец-2.

Позавчера в недрах гисэйда Том Пикок нашел очень сильно мутировавшего потомка B.1.1. - 3 сиквенса из Ботсваны и 1 из Гонконга (у пациента, вернувшегося из Южной Африки). Вариант сидит на очень длинной ветви филогенетического дерева - как и в случае альфы ученые считают это признаком того, что вариант возник у пациента с иммунодефицитом или иммуносупрессией, хронически инфицированного SARS-CoV-2.

Мутации в спайке: A67V, Δ69-70, T95I, G142D/Δ143-145, Δ211/L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F

Мутации вне спайка: NSP3 – K38R, V1069I, Δ1265/L1266I, A1892T; NSP4 – T492I; NSP5 – P132H; NSP6 – Δ105-107, A189V; NSP12 – P323L; NSP14 – I42V; E – T9I; M – D3G, Q19E, A63T; N – P13L, Δ31-33, R203K, G204R

Ко вчерашнему дню этот вариант получил наименование B.1.1.529, сиквенсов в базе уже более 10.

К сегодняшнему дню есть веские основания думать, что именно он стоит за скачком заболеваемости в южноафриканской провинции Гаутенг (Йоханнесбург, Претория), вспышкой ковида в Университете Претории и резким ростом числа новых случаев ковида в ЮАР (1275 новых случаев за последние сутки, из них 1018 в Гаутенге, основной рост в группе 10-29 лет). 100% найденных ноябрьских сиквенсов из провинции Гаутенг - вариант B.1.1.529. Как минимум один из образцов нового варианта получен от вакцинированного с ковидом, еще один заболевший - младенец.

Слайды и больше деталей ниже⬇️

BY @coronamed