@coronamed

11 ноября NEJM опубликовал описание случая персистенции и мутации SARS-CoV2 в организме иммунодефицитного пациента.

"Чудо чудесное" почти 5 месяцев персистировало, дало три рекурренции (в двух из трех в носоглотке пациента был обнаружен жизнеспособный вирус) и в финале убило 45-летнего мужчину с катастрофическим антифосфолипидным синдромом.

Диагноз АФС был поставлен мужчине в 1998 году. За пять месяцев до обращения у пациента было диагностировано диффузное альвеолярное кровотечение ДАК (редкое осложнение АФС), на момент обращения в одну из больниц Бостона он принимал непрямой антикоагулянт варфарин, иммунодепрессант гидроксихлорохин, цитостатик циклофосфамид и глюкокортикостероид преднизолон (15 мг в день), а также прошёл курс ритуксимаба и экулизумаба (последний - один из самых дорогих препаратов в мире, кстати говоря).

Пациент обратился за помощью с симптомами вирусной инфекции (подробно описаны в публикации), день получения положительного результата ПЦР-теста после двух отрицательных принят за День 0. Пациенту был назначен 5-дневный курс ремдесивира, из-за подозрения на ДАК доза ГКС была увеличена. В день 5 пациент был выписан, в оксигенотерапии не нуждался.

В период с 6 по 68 день пациент был госпитализирован четырежды, на 4 день очередной госпитализации по поводу гипоксемии (день 72) ПЦР-тест дал положительный результат (первая рекурренция). Пациент снова получил ремдесивир (10-дневный курс), в дальнейшем результаты ПЦР были отрицательными.

На 105 день пациент был госпитализирован по поводу целлюлита (гнойное воспаление подкожной клетчатки), на 111-й день у него развилась гипоксемия, к 126 дню он был переведен на высокопоточную оксигенотерапию в ОРИТ, где получил пульс-терапию высокими дозами ГКС (1000 мг метилпреднизолона в течение 3 дней, далее 1 мг/кг/день). На 128 день последовал положительный результат ПЦР-теста (вторая рекурренция), очередной 5-дневный курс ремдесивира и отрицательный тест. В дополнение к ГКС пациент в течение 3 дней получал иммуноглобулин и циклофосфамид в/в, а таже руксолитиниб ежедневно.

Положительный ПЦР-тест на 143 день определен как третья рекурренция. В рамках compassionate use ухудшающийся пациент получил 8 мг поликлонального коктейля Regeneron. На 150 день пациент был интубирован, на 151 день в БАЛ обнаруживался SARS-CoV2 и оппортунист Aspergillus fumigatus. Пациент умер на 154 день.

Филогенетический анализ подтвердил персистенцию и ускоренную эволюцию вируса в организме иммунокомпрометированного пациента. Замены аминокислот происходили преимущественно в гене шипа и рецептор-связывающего домена: они составляют 13% и 2% вирусного генома, но на их долю пришлись 57% и 38% мутаций.

Исследования инфекционности подтвердили наличие жизнеспособного вируса в образцах из носоглотки, взятых на 75 и 143 дни болезни.

The New England Journal of Medicine

Persistence and Evolution of SARS-CoV-2 in an Immunocompromised Host | NEJM

This letter describes an immunocompromised patient who had persistent infection with
SARS-CoV-2 over a period of months, despite several courses of remdesivir. Phylogenetic
analysis showed accelera...

www.group-telegram.com/ye/coronamed.com/812

2.0K viewsedited  Nov 16, 2020 at 19:31

11 ноября NEJM опубликовал описание случая персистенции и мутации SARS-CoV2 в организме иммунодефицитного пациента.

"Чудо чудесное" почти 5 месяцев персистировало, дало три рекурренции (в двух из трех в носоглотке пациента был обнаружен жизнеспособный вирус) и в финале убило 45-летнего мужчину с катастрофическим антифосфолипидным синдромом.

Диагноз АФС был поставлен мужчине в 1998 году. За пять месяцев до обращения у пациента было диагностировано диффузное альвеолярное кровотечение ДАК (редкое осложнение АФС), на момент обращения в одну из больниц Бостона он принимал непрямой антикоагулянт варфарин, иммунодепрессант гидроксихлорохин, цитостатик циклофосфамид и глюкокортикостероид преднизолон (15 мг в день), а также прошёл курс ритуксимаба и экулизумаба (последний - один из самых дорогих препаратов в мире, кстати говоря).

Пациент обратился за помощью с симптомами вирусной инфекции (подробно описаны в публикации), день получения положительного результата ПЦР-теста после двух отрицательных принят за День 0. Пациенту был назначен 5-дневный курс ремдесивира, из-за подозрения на ДАК доза ГКС была увеличена. В день 5 пациент был выписан, в оксигенотерапии не нуждался.

В период с 6 по 68 день пациент был госпитализирован четырежды, на 4 день очередной госпитализации по поводу гипоксемии (день 72) ПЦР-тест дал положительный результат (первая рекурренция). Пациент снова получил ремдесивир (10-дневный курс), в дальнейшем результаты ПЦР были отрицательными.

На 105 день пациент был госпитализирован по поводу целлюлита (гнойное воспаление подкожной клетчатки), на 111-й день у него развилась гипоксемия, к 126 дню он был переведен на высокопоточную оксигенотерапию в ОРИТ, где получил пульс-терапию высокими дозами ГКС (1000 мг метилпреднизолона в течение 3 дней, далее 1 мг/кг/день). На 128 день последовал положительный результат ПЦР-теста (вторая рекурренция), очередной 5-дневный курс ремдесивира и отрицательный тест. В дополнение к ГКС пациент в течение 3 дней получал иммуноглобулин и циклофосфамид в/в, а таже руксолитиниб ежедневно.

Положительный ПЦР-тест на 143 день определен как третья рекурренция. В рамках compassionate use ухудшающийся пациент получил 8 мг поликлонального коктейля Regeneron. На 150 день пациент был интубирован, на 151 день в БАЛ обнаруживался SARS-CoV2 и оппортунист Aspergillus fumigatus. Пациент умер на 154 день.

Филогенетический анализ подтвердил персистенцию и ускоренную эволюцию вируса в организме иммунокомпрометированного пациента. Замены аминокислот происходили преимущественно в гене шипа и рецептор-связывающего домена: они составляют 13% и 2% вирусного генома, но на их долю пришлись 57% и 38% мутаций.

Исследования инфекционности подтвердили наличие жизнеспособного вируса в образцах из носоглотки, взятых на 75 и 143 дни болезни.

BY @coronamed